RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 WRNIP1Q96S55 665 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 PHF20L1A8MW92 1017 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 FOXP2O15409 715 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 MAP3K9P80192 1104 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 DDRGK1Q96HY6 314 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 CLMNQ96JQ2 1002 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
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PKDCC-202ENST00000401498 USP17L12C9JPN9 530 aa36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L21D6R901 530 aa36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 APPP05067 770 aa36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 CYP2D6P10635 497 aa36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 VPS53Q5VIR6 699 aa36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 IFNL3Q8IZI9 196 aa36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 DNAJC18Q9H819 358 aa36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC171Q6TFL3 1326 aa36.04■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 INPP5BP32019 993 aa36.04■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 CYP4F22Q6NT55 531 aa36.04■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 CTR9Q6PD62 1173 aa36.04■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa36.04■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 IL25Q9H293 177 aa36.04■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 EHD4Q9H223 541 aa36.03■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
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PKDCC-202ENST00000401498 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa36.02■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 SMIM22K7EJ46 135 aa36.02■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 VGLL4Q14135 290 aa36.02■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 C12orf60Q5U649 245 aa36.02■■■■□ 3.36
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PKDCC-202ENST00000401498 VEGFBP49765 207 aa36■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 SBK1Q52WX2 424 aa36■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 NACAP1Q9BZK3 213 aa36■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 TDO2P48775 406 aa35.99■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 GABPAQ06546 454 aa35.99■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 SLC10A4Q96EP9 437 aa35.99■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 CAPNS2Q96L46 248 aa35.99■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
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PKDCC-202ENST00000401498 TRIM34Q9BYJ4 488 aa35.98■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 CSADQ9Y600 493 aa35.98■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa35.98■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 GRM1Q13255 1194 aa35.98■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 AMOTL1Q8IY63 956 aa35.98■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 ELP3Q9H9T3 547 aa35.98■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 RUFY2Q8WXA3 655 aa35.97■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC102AQ96A19 550 aa35.97■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 NAPBQ9H115 298 aa35.97■■■■□ 3.35
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PKDCC-202ENST00000401498 SLC10A3P09131 477 aa35.96■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 DYNLL2Q96FJ2 89 aa35.96■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 RAD50Q92878 1312 aa35.96■■■■□ 3.35
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PKDCC-202ENST00000401498 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 ECE1P42892 770 aa35.95■■■■□ 3.35
PKDCC-202ENST00000401498 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
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PKDCC-202ENST00000401498 ALX1Q15699 326 aa35.94■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 TATDN1Q6P1N9 297 aa35.94■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 DOCK1Q14185 1865 aa35.94■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 ATAD5Q96QE3 1844 aa35.94■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 SHMT1P34896 483 aa35.93■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa35.93■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 SGSM2O43147 1006 aa35.93■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 FGAP02671 866 aa35.93■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 CAP2P40123 477 aa35.93■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 SCYL3Q8IZE3 742 aa35.93■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 SLC44A5Q8NCS7 719 aa35.93■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 AOC2O75106 756 aa35.91■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 GJA5P36382 358 aa35.91■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 SPRYD7Q5W111 196 aa35.91■■■■□ 3.34
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PKDCC-202ENST00000401498 MYH8P13535 1937 aa35.91■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 JAG1P78504 1218 aa35.9■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 C16orf86Q6ZW13 317 aa35.9■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 ZIC5Q96T25 663 aa35.9■■■■□ 3.34
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PKDCC-202ENST00000401498 SPDYE5A6NIY4 337 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 ERO1BQ86YB8 467 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 SWAP70Q9UH65 585 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 ROBO3Q96MS0 1386 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 ZMYM6O95789 1325 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 CDC45O75419 566 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 GDF11O95390 407 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 CDK8P49336 464 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-202ENST00000401498 DSCC1Q9BVC3 393 aa35.89■■■■□ 3.34
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