RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ACAD11Q709F0 780 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 GMLQ99445 158 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 WDR18Q9BV38 432 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 BPNT1O95861 308 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRNPP04156 253 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 SOX9P48436 509 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 MSMPQ1L6U9 139 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD34AQ69YU3 496 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 REC114Q7Z4M0 266 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBXO27Q8NI29 283 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 RUSC1Q9BVN2 902 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF208Q9H0X6 261 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 SUGCTQ9HAC7 445 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBP1Q9NZI7 540 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 MEGF11A6BM72 1044 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 TIAF1O95411 115 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADH5P11766 374 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMPRSS2O15393 492 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 AOC2O75106 756 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITGB5P18084 799 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIG1P18858 919 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARID5AQ03989 594 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARMC5Q96C12 935 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 GINM1Q9NU53 330 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-190P-201ENST00000384154 NTF4P34130 210 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 PREPP48147 710 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDK8P49336 464 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 ERVK-24P63145 666 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 ID3Q02535 119 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEZ6Q53EL9 994 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 BEND4Q6ZU67 534 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 ABI1Q8IZP0 508 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 NKD1Q969G9 470 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 PIM2Q9P1W9 311 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNRF3Q9ULT6 936 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 GFRA2O00451 464 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 BMP3P12645 472 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 RING1Q06587 406 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 INPP5AQ14642 412 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUTM2GQ5VZR2 741 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 OGFOD2Q6N063 350 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 FDX2Q6P4F2 183 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 HDXQ7Z353 690 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP4F12Q9HCS2 524 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLFN14P0C7P3 912 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 IMPDH2P12268 514 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 FOSL1P15407 271 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF165P49910 485 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.8 ms