RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 NEDD4P46934 1319 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 SHTN1A0MZ66 631 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 PRC1O43663 620 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 NFIAQ12857 509 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZUG5 572 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF3Q9H094 633 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 GLTPD2A6NH11 291 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 TSPY2A6NKD2 308 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 KDM4AO75164 1064 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 PLCD1P51178 756 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 AK2P54819 239 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 IQCA1Q86XH1 822 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 FAM151AQ8WW52 585 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM87BQ96K49 555 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 SWAP70Q9UH65 585 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 SCN4AP35499 1836 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 ORC4O43929 436 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 EPS15P42566 896 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 CHST3Q7LGC8 479 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 FAM83AQ86UY5 434 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 TTC14Q96N46 770 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 INCENPQ9NQS7 918 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 HACL1Q9UJ83 578 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 PRDM1O75626 825 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 TSPY3P0CV98 308 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 TSPY8P0CW00 308 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 CDK8P49336 464 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 CSRNP1Q96S65 589 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 MTA3Q9BTC8 594 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 EHD4Q9H223 541 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRK-201ENST00000368202 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 EGFRP00533 1210 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 FGRP09769 529 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 WTAPQ15007 396 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 BRF1Q92994 677 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 UTRNP46939 3433 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 WDR90Q96KV7 1748 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC69A6NI79 296 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TFAP4Q01664 338 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TMTC2Q8N394 836 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 HOOK2Q96ED9 719 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 GGA3Q9NZ52 723 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SIPA1L1O43166 1804 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM22K7EJ46 135 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 EPHX2P34913 555 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ANTXR2P58335 489 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 EVX2Q03828 476 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.1 ms