RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 PF4P02776 101 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOSL1P15407 271 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMNB2Q03252 620 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED26O95402 600 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 BPNT1O95861 308 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBRSQ9HAH7 460 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 GGT7Q9UJ14 662 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFRA2O00451 464 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 LEFTY1O75610 366 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRIG2O94898 1065 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPINK2P20155 84 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRK4P32298 578 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF11Q86T75 865 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 BACH2Q9BYV9 841 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 COPRSQ9NQ92 184 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CILPO75339 1184 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 F13A1P00488 732 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGRP06401 933 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE4BQ07343 736 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKG7Q16617 165 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSMPQ1L6U9 139 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 DTX1Q86Y01 620 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 HID1Q8IV36 788 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS22Q8NE09 1264 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM221AA4D161 298 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 RECKO95980 971 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF76P36508 570 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAP2P40123 477 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXQ1Q9C009 403 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 GARTP22102 1010 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 VAMP1P23763 118 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FANCCQ00597 558 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPP2Q14168 576 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 XP32Q5T750 250 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIPEPQ99797 713 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRIN3BO60391 1043 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLCG1P19174 1290 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 REC114Q7Z4M0 266 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 VSIG10LQ86VR7 867 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO27Q8NI29 283 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM87BQ96K49 555 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms