RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358355.5

USP20-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,371 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-202ENST00000358355 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CIAO1O76071 339 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CTNNA2P26232 953 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ANO1Q5XXA6 986 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 MCM3P25205 808 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PPARAQ07869 468 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ELP1O95163 1332 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 SP4Q02446 784 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.57□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ZNF521Q96K83 1311 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PPP1R2P41236 205 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 FAM193AP78312 1265 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CCDC102AQ96A19 550 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 SV2BQ7L1I2 683 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 MYL10Q9BUA6 226 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 BBOX1O75936 387 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 SERPINB2P05120 415 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 DRC1Q96MC2 740 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PLVAPQ9BX97 442 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.56□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 XDHP47989 1333 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 A0A0D9SFI3 127 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 A0A1B0GVL5 298 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 UBE3CQ15386 1083 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 BARGINQ6ZT62 677 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 SEMA3EO15041 775 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PHKA1P46020 1223 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 GNG11P61952 73 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 TAF3Q5VWG9 929 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 NLRP10Q86W26 655 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CPXCR1Q8N123 301 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ATG3Q9NT62 314 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ZBED4O75132 1171 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 TXNRD1Q16881 649 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 KRT40Q6A162 431 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 HOOK3Q86VS8 718 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PLIN2Q99541 437 aa14.55□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ADCY7P51828 1080 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 STX17P56962 302 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PHKBQ93100 1093 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 STAP2Q9UGK3 403 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 TTC38Q5R3I4 469 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 PALLDQ8WX93 1383 aa14.54□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 SKILP12757 684 aa14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 NSMFQ6X4W1 530 aa14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 DOK7Q18PE1 504 aa14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CPDO75976 1380 aa14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 SYNCQ9H7C4 482 aa14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP20-202ENST00000358355 CUTAO60888 179 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms