RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 BACH1O14867 736 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 CROCCP2Q86T23 111 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 LGR6Q9HBX8 967 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ELF2Q15723 593 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 TOM1O60784 492 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 TXKP42681 527 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 INF2Q27J81 1249 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 JAG2Q9Y219 1238 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRL2O95490 1459 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K9P80192 1104 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC14Q49A88 953 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 IQCDQ96DY2 449 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 FNBP1Q96RU3 617 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 JAK2O60674 1132 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRTO14522 1441 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SMTNP53814 917 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD1Q99460 953 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA1P43355 309 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ADALQ6DHV7 355 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 TSKSQ9UJT2 592 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 E7EWF7 191 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 RIMBP2O15034 1052 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF354CQ86Y25 554 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SWAP70Q9UH65 585 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAB1O14561 156 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SSH3Q8TE77 659 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 PHKBQ93100 1093 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF10O15013 1369 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM1O75626 825 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6CA6NDK9 693 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 BIRC3Q13489 604 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 DPH6Q7L8W6 267 aa23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM7Q9C029 511 aa23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC51Q96ER9 411 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 IFT74Q96LB3 600 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 STX10O60499 249 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ME3Q16798 604 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 CNBD1Q8NA66 436 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 MAST3O60307 1309 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 KRT5P13647 590 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA5Q8NB90 893 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 NDC80O14777 642 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY7P51828 1080 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 MTX1Q13505 466 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 CLUL1Q15846 466 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 UFL1O94874 794 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ZAP70P43403 619 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 JDP2Q8WYK2 163 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 MAP7D1Q3KQU3 841 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 MYL10Q9BUA6 226 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF365Q70YC5 407 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms