RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 ADD2P35612 726 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 TXLNAP40222 546 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 LY9Q9HBG7 655 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 H3BQF6 201 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 GUCY1A2P33402 732 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 MORC3Q14149 939 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 MLKLQ8NB16 471 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB9Q96C00 473 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 GPS2Q13227 327 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 NR1I3Q14994 352 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 FAM89AQ96GI7 184 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 TEX33O43247 280 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC175P0C221 793 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM87BQ96K49 555 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC151A5D8V7 595 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 CHMP4BP1P59074 171 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 DACH1Q9UI36 760 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 ABCC12Q96J65 1359 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 PTPREP23469 700 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 ZSCAN26Q16670 478 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 ADAM21Q9UKJ8 722 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH3-201ENST00000272133 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.33■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 MMP1P03956 469 aa21.33■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 USP49Q70CQ1 688 aa21.33■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.33■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.33■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.33■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 A0A1B0GTH6 734 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 METTL24Q5JXM2 366 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 FBXO3Q9UK99 471 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.32■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 MAP2K7O14733 419 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 ATP2B1P20020 1258 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 LMAN1P49257 510 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 SLC20A2Q08357 652 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 NR5A1Q13285 461 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 PLCD1P51178 756 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 RBL2Q08999 1139 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 SYNE4Q8N205 404 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 PANX2Q96RD6 677 aa21.31■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 STK36Q9NRP7 1315 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 MCM6Q14566 821 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 BRD3Q15059 726 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 ATRNO75882 1429 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 PNKPQ96T60 521 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.3■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 STX17P56962 302 aa21.29■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.29■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 PDE6AP16499 860 aa21.29■■□□□ 1
CNIH3-201ENST00000272133 TCIRG1Q13488 830 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms