RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268082.4

CCDC33-201, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC33, Length 2,093 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-201ENST00000268082 PHKBQ93100 1093 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 TNNT1P13805 278 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 RXRAP19793 462 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 KCNQ4P56696 695 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 NBPF11Q86T75 865 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 NHSQ6T4R5 1651 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 NCAPHQ15003 741 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 SHC4Q6S5L8 630 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 TMTC2Q8N394 836 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 MYO1BO43795 1136 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 KCNJ6P48051 423 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 TDO2P48775 406 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 LCORLQ8N3X6 602 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 ANKRD7Q92527 254 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 MMP1P03956 469 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 SKILP12757 684 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 ATP6V1AP38606 617 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 WTAPQ15007 396 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-201ENST00000268082 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 SIK1P57059 783 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CHRNDQ07001 517 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 PPP2R5BQ15173 497 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 RTN1Q16799 776 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 ERICH2A1L162 156 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 DEXIO95424 95 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 BCAMP50895 628 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 ARID5BQ14865 1188 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 MYL10Q9BUA6 226 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 INCENPQ9NQS7 918 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 PRKAB2O43741 272 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 TSC1Q92574 1164 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 SNAP23O00161 211 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 RGL2O15211 777 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 PPARAQ07869 468 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 ITPK1Q13572 414 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CEP135Q66GS9 1140 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 PROM2Q8N271 834 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 FBXW7Q969H0 707 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 IFNKQ9P0W0 207 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 BIN1O00499 593 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 MYL5Q02045 173 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CBFA2T2O43439 604 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 SMC2O95347 1197 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 UBE4AQ14139 1066 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 PTPN14Q15678 1187 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 FAM177BA6PVY3 158 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 NRDCO43847 1150 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-201ENST00000268082 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms