RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CABS1Q96KC9 395 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 TTC36A6NLP5 189 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 EYA2O00167 538 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CHGBP05060 677 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 TIMM10P62072 90 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 TMC6Q7Z403 805 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CRYMQ14894 314 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 APBA3O96018 575 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 NLRP10Q86W26 655 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 PGBD1Q96JS3 809 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 FAM169AQ9Y6X4 670 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN12O43309 604 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 PDCP20941 246 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CPA1P15085 419 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 PAX7P23759 505 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 NF2P35240 595 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 HIP1O00291 1037 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 CHUKO15111 745 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 SNRKQ9NRH2 765 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 NUP98P52948 1817 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 FERMT3Q86UX7 667 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 NECTIN1Q15223 517 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 CCDC102AQ96A19 550 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 HAUS7Q99871 368 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 MED23Q9ULK4 1368 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 EBAG9O00559 213 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 CSF1RP07333 972 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 INPP5BP32019 993 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 BORCS6Q96GS4 357 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 SLC24A3Q9HC58 644 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 LY75O60449 1722 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 CIAO1O76071 339 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ST3GAL1Q11201 340 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 MAP4K1Q92918 833 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 NBPF3Q9H094 633 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 GPR108Q9NPR9 543 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ZNF609O15014 1411 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 FAM210AQ96ND0 272 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 CLIC6Q96NY7 704 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 TUBB4BP68371 445 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 GRIK3Q13003 919 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 CASP8Q14790 479 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 PROM2Q8N271 834 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 KCNB2Q92953 911 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 TATDN2Q93075 761 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ADCY2Q08462 1091 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 GBP3Q9H0R5 595 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 XAGE2Q96GT9 111 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 ABCB6Q9NP58 842 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms