RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST20Q9HBF5 79 aa-7.95□□□□□ -3.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB124Q8NES8 71 aa-7.96□□□□□ -3.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-7.97□□□□□ -3.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGLP35573 1532 aa-7.97□□□□□ -3.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 H0YGX0 51 aa-7.98□□□□□ -3.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFAT5O94916 1531 aa-7.98□□□□□ -3.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01549A6NIU2 74 aa-7.99□□□□□ -3.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100ZQ8WXG8 99 aa-7.99□□□□□ -3.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-8□□□□□ -3.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCA6Q8N139 1617 aa-8□□□□□ -3.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-8.01□□□□□ -3.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-8.02□□□□□ -3.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-8.04□□□□□ -3.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADIRFQ15847 76 aa-8.04□□□□□ -3.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 C18orf32Q8TCD1 76 aa-8.04□□□□□ -3.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOMM7Q9P0U1 55 aa-8.06□□□□□ -3.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q9H521 79 aa-8.08□□□□□ -3.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLTCL1P53675 1640 aa-8.1□□□□□ -3.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-8.11□□□□□ -3.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-8.11□□□□□ -3.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-8.11□□□□□ -3.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRPM2O94759 1503 aa-8.13□□□□□ -3.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNG13Q9P2W3 67 aa-8.13□□□□□ -3.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01556Q5JQF7 62 aa-8.18□□□□□ -3.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 PKIAP61925 76 aa-8.19□□□□□ -3.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADCY10Q96PN6 1610 aa-8.19□□□□□ -3.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRXQ9BXM0 1461 aa-8.19□□□□□ -3.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-8.2□□□□□ -3.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 V9GYS6 101 aa-8.24□□□□□ -3.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A13Q99584 98 aa-8.33□□□□□ -3.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-8.35□□□□□ -3.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLNP26678 52 aa-8.35□□□□□ -3.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDCD5O14737 125 aa-8.43□□□□□ -3.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQGAP1P46940 1657 aa-8.46□□□□□ -3.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-8.48□□□□□ -3.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFA1O15239 70 aa-8.48□□□□□ -3.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPS1P31327 1500 aa-8.51□□□□□ -3.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-8.53□□□□□ -3.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-8.66□□□□□ -3.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-8.75□□□□□ -3.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-8.8□□□□□ -3.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-8.85□□□□□ -3.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-8.88□□□□□ -3.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BUX3 64 aa-8.89□□□□□ -3.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-8.93□□□□□ -3.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-8.96□□□□□ -3.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP7AQ04656 1500 aa-9□□□□□ -3.85
RNU6-871P-201ENST00000516122 APELAP0DMC3 54 aa-9.01□□□□□ -3.85
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-9.03□□□□□ -3.85
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-9.03□□□□□ -3.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCC8Q09428 1581 aa-9.03□□□□□ -3.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFCAB5A4FU69 1503 aa-9.09□□□□□ -3.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-9.09□□□□□ -3.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A096LPF7 62 aa-9.12□□□□□ -3.87
RNU6-871P-201ENST00000516122 CMC2Q9NRP2 79 aa-9.13□□□□□ -3.87
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A087WWC5 75 aa-9.15□□□□□ -3.87
RNU6-871P-201ENST00000516122 MROH2BQ7Z745 1585 aa-9.26□□□□□ -3.89
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNG2P59768 71 aa-9.33□□□□□ -3.9
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTN3P15516 51 aa-9.35□□□□□ -3.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM5Q71RC9 77 aa-9.46□□□□□ -3.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 K7EIM0 57 aa-9.6□□□□□ -3.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRCDQ00LT1 54 aa-9.72□□□□□ -3.97
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-9.82□□□□□ -3.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BSH0 61 aa-9.89□□□□□ -3.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-9.94□□□□□ -4
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-10.08□□□□□ -4.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q9Y3F1 56 aa-10.08□□□□□ -4.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQGAP2Q13576 1575 aa-10.11□□□□□ -4.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX14Q96I36 57 aa-10.43□□□□□ -4.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL39P5Q59GN2 51 aa-10.59□□□□□ -4.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOMM5Q8N4H5 51 aa-10.69□□□□□ -4.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB108AA8MXU0 73 aa-10.7□□□□□ -4.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-10.72□□□□□ -4.13
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB108BQ8NET1 73 aa-10.78□□□□□ -4.14
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-10.92□□□□□ -4.16
RNU6-871P-201ENST00000516122 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-11.01□□□□□ -4.17
RNU6-871P-201ENST00000516122 STATHP02808 62 aa-11.2□□□□□ -4.2
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms