RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503501.1

SENP6-212, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 2,041 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-212ENST00000503501 M0R1W7 72 aa-1.33□□□□□ -2.62
SENP6-212ENST00000503501 FAUP35544 74 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
SENP6-212ENST00000503501 SELENOWP63302 87 aa-1.33□□□□□ -2.62
SENP6-212ENST00000503501 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-212ENST00000503501 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-212ENST00000503501 DEFB131AP59861 70 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-212ENST00000503501 NMES1Q9C002 83 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-212ENST00000503501 LINC00470Q9BZP3 86 aa-1.35□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 A0A087WXM4 84 aa-1.35□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 GNG7O60262 68 aa-1.35□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 NDUFA1O15239 70 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 NDUFA2O43678 99 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 PPP3R1P63098 170 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 GNG4P50150 75 aa-1.39□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 SMIM2Q9BVW6 85 aa-1.39□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-1.39□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-1.39□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.39□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-1.39□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-1.39□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 PRCDQ00LT1 54 aa-1.4□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 TMEM203Q969S6 136 aa-1.4□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 SMIM13P0DJ93 91 aa-1.4□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-1.4□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 TSC22D3Q99576 134 aa-1.4□□□□□ -2.63
SENP6-212ENST00000503501 GYPAP02724 150 aa-1.41□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 S100A10P60903 97 aa-1.41□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 S100A12P80511 92 aa-1.42□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 K7EMI3 77 aa-1.42□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.42□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 S100ZQ8WXG8 99 aa-1.44□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 DLEU1O43261 78 aa-1.44□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-1.45□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 HMGN1P05114 100 aa-1.45□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 H3BUT2 72 aa-1.45□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 CORTO00230 105 aa-1.45□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 SERF2P84101 59 aa-1.46□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 H3BVH4 76 aa-1.47□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 GNG8Q9UK08 70 aa-1.47□□□□□ -2.64
SENP6-212ENST00000503501 PDCD5O14737 125 aa-1.47□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 ATXN8Q156A1 80 aa-1.47□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 TOMM7Q9P0U1 55 aa-1.47□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-1.49□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 PYY3Q5JQD4 70 aa-1.49□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 A0A1B0GV90 55 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 H0YGX0 51 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 Q9H521 79 aa-1.53□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 GNG13Q9P2W3 67 aa-1.53□□□□□ -2.65
SENP6-212ENST00000503501 K7EIM0 57 aa-1.54□□□□□ -2.66
SENP6-212ENST00000503501 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-212ENST00000503501 ADIRFQ15847 76 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-212ENST00000503501 LINC01549A6NIU2 74 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-212ENST00000503501 IGIPA6NJ69 53 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-212ENST00000503501 ST20Q9HBF5 79 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-212ENST00000503501 PLNP26678 52 aa-1.57□□□□□ -2.66
SENP6-212ENST00000503501 M0R143 59 aa-1.57□□□□□ -2.66
SENP6-212ENST00000503501 C18orf32Q8TCD1 76 aa-1.61□□□□□ -2.67
SENP6-212ENST00000503501 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-1.61□□□□□ -2.67
SENP6-212ENST00000503501 S100A13Q99584 98 aa-1.61□□□□□ -2.67
SENP6-212ENST00000503501 EFCAB10A6NFE3 127 aa-1.62□□□□□ -2.67
SENP6-212ENST00000503501 V9GYS6 101 aa-1.62□□□□□ -2.67
SENP6-212ENST00000503501 C14orf144Q96I85 54 aa-1.64□□□□□ -2.67
SENP6-212ENST00000503501 RPL39P5Q59GN2 51 aa-1.64□□□□□ -2.67
SENP6-212ENST00000503501 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-1.66□□□□□ -2.68
SENP6-212ENST00000503501 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-1.69□□□□□ -2.68
SENP6-212ENST00000503501 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
SENP6-212ENST00000503501 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
SENP6-212ENST00000503501 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
SENP6-212ENST00000503501 CMC2Q9NRP2 79 aa-1.76□□□□□ -2.69
SENP6-212ENST00000503501 GNG2P59768 71 aa-1.88□□□□□ -2.71
SENP6-212ENST00000503501 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-2.05□□□□□ -2.74
SENP6-212ENST00000503501 TOMM5Q8N4H5 51 aa-2.05□□□□□ -2.74
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.5 ms