RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 WFDC13Q8IUB5 93 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 H0YAA0 97 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MTW9 85 aa0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BSH0 61 aa0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB106AQ8N104 65 aa0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC17Q685J3 4493 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB108AA8MXU0 73 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 KLK9Q2XQG4 91 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 KAAG1Q9UBP8 84 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC5ACP98088 5654 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB130BP0DP73 79 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB130AP0DP74 79 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB105AQ8NG35 78 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BUX3 64 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 LEAP2Q969E1 77 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 APLNQ9ULZ1 77 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CLPSL2Q6UWE3 100 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PRLHP81277 87 aa0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1HL1P0DM35 61 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL39P5Q59GN2 51 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 M0QZ58 72 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR2EP22531 72 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR2BP35325 72 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR2AP35326 72 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 S4R3F8 94 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR2DP22532 72 aa0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 H0YGG7 62 aa0.87□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 M0R2T5 61 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 COX14Q96I36 57 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa0.84□□□□□ -2.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1HP80294 61 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf92A6NGG3 77 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 MT4P47944 62 aa0.81□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 TNP1P09430 55 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BNG1 76 aa0.79□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB108BQ8NET1 73 aa0.79□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.79□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB135Q30KP9 77 aa0.78□□□□□ -2.28
RABGGTB-209ENST00000473406 SPART-AS1P0CW21 52 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-209ENST00000473406 APELAP0DMC3 54 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HTN1P15515 57 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS29P62273 56 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01556Q5JQF7 62 aa0.73□□□□□ -2.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB110Q30KQ9 67 aa0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB1P60022 68 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa0.69□□□□□ -2.3
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A096LNI7 61 aa0.68□□□□□ -2.3
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB136Q30KP8 78 aa0.67□□□□□ -2.3
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A096LPF7 62 aa0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PHGR1C9JFL3 82 aa0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.65□□□□□ -2.31
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB4AO15263 64 aa0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-209ENST00000473406 MT2AP02795 61 aa0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1FP04733 61 aa0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-209ENST00000473406 PRM1P04553 51 aa0.61□□□□□ -2.31
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.6□□□□□ -2.31
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1AP04731 61 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-209ENST00000473406 HTN3P15516 51 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.49□□□□□ -2.33
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1EP04732 61 aa0.47□□□□□ -2.33
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1LQ93083 61 aa0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1BP07438 61 aa0.43□□□□□ -2.34
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.42□□□□□ -2.34
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1XP80297 61 aa0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1GP13640 62 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-209ENST00000473406 MT1MQ8N339 61 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.27□□□□□ -2.37
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.9 ms