RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 VPS8Q8N3P4 1428 aa-2.85□□□□□ -2.87
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SHQ1-204ENST00000468347 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-2.88□□□□□ -2.87
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SHQ1-204ENST00000468347 GNG13Q9P2W3 67 aa-2.88□□□□□ -2.87
SHQ1-204ENST00000468347 EFCAB10A6NFE3 127 aa-2.89□□□□□ -2.87
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SHQ1-204ENST00000468347 C18orf32Q8TCD1 76 aa-2.9□□□□□ -2.87
SHQ1-204ENST00000468347 Q9H521 79 aa-2.9□□□□□ -2.87
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SHQ1-204ENST00000468347 H3BSH0 61 aa-3.61□□□□□ -2.99
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-3.63□□□□□ -2.99
SHQ1-204ENST00000468347 IQGAP2Q13576 1575 aa-3.64□□□□□ -2.99
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SHQ1-204ENST00000468347 COX14Q96I36 57 aa-3.98□□□□□ -3.05
SHQ1-204ENST00000468347 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-4.01□□□□□ -3.05
SHQ1-204ENST00000468347 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-4.02□□□□□ -3.05
SHQ1-204ENST00000468347 DEFB108BQ8NET1 73 aa-4.02□□□□□ -3.05
SHQ1-204ENST00000468347 STATHP02808 62 aa-4.16□□□□□ -3.08
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