RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 H0YGX0 51 aa-2.68□□□□□ -2.84
TTC3-211ENST00000460328 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-2.7□□□□□ -2.84
TTC3-211ENST00000460328 SYCP2Q9BX26 1530 aa-2.7□□□□□ -2.84
TTC3-211ENST00000460328 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-2.7□□□□□ -2.84
TTC3-211ENST00000460328 CENPFP49454 3210 aa-2.73□□□□□ -2.85
TTC3-211ENST00000460328 S100ZQ8WXG8 99 aa-2.74□□□□□ -2.85
TTC3-211ENST00000460328 MROH2AA6NES4 1674 aa-2.74□□□□□ -2.85
TTC3-211ENST00000460328 EFCAB5A4FU69 1503 aa-2.76□□□□□ -2.85
TTC3-211ENST00000460328 CPS1P31327 1500 aa-2.78□□□□□ -2.85
TTC3-211ENST00000460328 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-2.79□□□□□ -2.86
TTC3-211ENST00000460328 ASPMQ8IZT6 3477 aa-2.79□□□□□ -2.86
TTC3-211ENST00000460328 AGLP35573 1532 aa-2.8□□□□□ -2.86
TTC3-211ENST00000460328 TTTY10Q9BZA0 68 aa-2.83□□□□□ -2.86
TTC3-211ENST00000460328 PLNP26678 52 aa-2.85□□□□□ -2.87
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-2.85□□□□□ -2.87
TTC3-211ENST00000460328 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-2.85□□□□□ -2.87
TTC3-211ENST00000460328 SCRIBQ14160 1630 aa-2.86□□□□□ -2.87
TTC3-211ENST00000460328 A0A087WWC5 75 aa-2.87□□□□□ -2.87
TTC3-211ENST00000460328 SMIM2Q9BVW6 85 aa-2.87□□□□□ -2.87
TTC3-211ENST00000460328 BRCA2P51587 3418 aa-2.89□□□□□ -2.87
TTC3-211ENST00000460328 CDH23Q9H251 3354 aa-2.9□□□□□ -2.87
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TTC3-211ENST00000460328 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-2.93□□□□□ -2.88
TTC3-211ENST00000460328 IQGAP1P46940 1657 aa-2.94□□□□□ -2.88
TTC3-211ENST00000460328 CLTCL1P53675 1640 aa-2.96□□□□□ -2.88
TTC3-211ENST00000460328 NFAT5O94916 1531 aa-2.96□□□□□ -2.88
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TTC3-211ENST00000460328 VPS13AQ96RL7 3174 aa-2.99□□□□□ -2.89
TTC3-211ENST00000460328 TRPM2O94759 1503 aa-3□□□□□ -2.89
TTC3-211ENST00000460328 SMIM5Q71RC9 77 aa-3.01□□□□□ -2.89
TTC3-211ENST00000460328 NDUFA1O15239 70 aa-3.1□□□□□ -2.91
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TTC3-211ENST00000460328 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-3.14□□□□□ -2.91
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TTC3-211ENST00000460328 XIRP2A4UGR9 3374 aa-3.2□□□□□ -2.92
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TTC3-211ENST00000460328 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-3.22□□□□□ -2.92
TTC3-211ENST00000460328 A0A096LNI7 61 aa-3.24□□□□□ -2.93
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TTC3-211ENST00000460328 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-3.34□□□□□ -2.94
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TTC3-211ENST00000460328 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-3.39□□□□□ -2.95
TTC3-211ENST00000460328 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-3.41□□□□□ -2.96
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TTC3-211ENST00000460328 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-3.48□□□□□ -2.97
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TTC3-211ENST00000460328 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-3.57□□□□□ -2.98
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TTC3-211ENST00000460328 MROH2BQ7Z745 1585 aa-3.72□□□□□ -3
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TTC3-211ENST00000460328 H3BUX3 64 aa-3.8□□□□□ -3.02
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TTC3-211ENST00000460328 APELAP0DMC3 54 aa-3.99□□□□□ -3.05
TTC3-211ENST00000460328 A0A096LPF7 62 aa-4.06□□□□□ -3.06
TTC3-211ENST00000460328 K7EIM0 57 aa-4.07□□□□□ -3.06
TTC3-211ENST00000460328 HTN3P15516 51 aa-4.18□□□□□ -3.08
TTC3-211ENST00000460328 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-4.19□□□□□ -3.08
TTC3-211ENST00000460328 PRCDQ00LT1 54 aa-4.21□□□□□ -3.08
TTC3-211ENST00000460328 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-4.26□□□□□ -3.09
TTC3-211ENST00000460328 H3BSH0 61 aa-4.43□□□□□ -3.12
TTC3-211ENST00000460328 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-4.43□□□□□ -3.12
TTC3-211ENST00000460328 Q9Y3F1 56 aa-4.45□□□□□ -3.12
TTC3-211ENST00000460328 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-4.5□□□□□ -3.13
TTC3-211ENST00000460328 RPL39P5Q59GN2 51 aa-4.59□□□□□ -3.14
TTC3-211ENST00000460328 DEFB108AA8MXU0 73 aa-4.67□□□□□ -3.16
TTC3-211ENST00000460328 COX14Q96I36 57 aa-4.72□□□□□ -3.17
TTC3-211ENST00000460328 STATHP02808 62 aa-4.84□□□□□ -3.18
TTC3-211ENST00000460328 DEFB108BQ8NET1 73 aa-4.85□□□□□ -3.19
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