RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC172P0C7W6 258 aa-3.82□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00643Q86TS7 51 aa-3.82□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6V1E1P36543 226 aa-3.83□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-3.83□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 LZICQ8WZA0 190 aa-3.83□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 S100A11P31949 105 aa-3.84□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GV50 99 aa-3.85□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 PPP3R1P63098 170 aa-3.85□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 CMC2Q9NRP2 79 aa-3.85□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM11AP58511 58 aa-3.86□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-3.86□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 S100A6P06703 90 aa-3.87□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-3.87□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 E5RI56 91 aa-3.88□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 BANF1O75531 89 aa-3.88□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 GNG2P59768 71 aa-3.88□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 GNG13Q9P2W3 67 aa-3.88□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 GNG8Q9UK08 70 aa-3.88□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 DLEU1O43261 78 aa-3.89□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 FAUP35544 74 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 CETN1Q12798 172 aa-3.89□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-3.89□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 C18orf32Q8TCD1 76 aa-3.89□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 C6orf50Q9HD87 102 aa-3.89□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 RIIAD1A6NNX1 92 aa-3.9□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 GNGT2O14610 69 aa-3.9□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 ANAPC15P60006 121 aa-3.9□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-3.9□□□□□ -3.03
SNORD54-201ENST00000459159 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-3.91□□□□□ -3.04
SNORD54-201ENST00000459159 PCP4P48539 62 aa-3.92□□□□□ -3.04
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM3Q9BZL3 60 aa-3.92□□□□□ -3.04
SNORD54-201ENST00000459159 DR1Q01658 176 aa-3.93□□□□□ -3.04
SNORD54-201ENST00000459159 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-3.94□□□□□ -3.04
SNORD54-201ENST00000459159 APOC2P02655 101 aa-3.95□□□□□ -3.04
SNORD54-201ENST00000459159 CHMP3Q9Y3E7 222 aa-3.95□□□□□ -3.04
SNORD54-201ENST00000459159 EFCAB10A6NFE3 127 aa-3.98□□□□□ -3.05
SNORD54-201ENST00000459159 HSBP1O75506 76 aa-3.98□□□□□ -3.05
SNORD54-201ENST00000459159 CROCCP2Q86T23 111 aa-3.98□□□□□ -3.05
SNORD54-201ENST00000459159 ADIRFQ15847 76 aa-4□□□□□ -3.05
SNORD54-201ENST00000459159 C14orf144Q96I85 54 aa-4□□□□□ -3.05
SNORD54-201ENST00000459159 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa-4.01□□□□□ -3.05
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM30A4D0T7 59 aa-4.03□□□□□ -3.05
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC167Q9P0B6 97 aa-4.03□□□□□ -3.05
SNORD54-201ENST00000459159 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-4.04□□□□□ -3.06
SNORD54-201ENST00000459159 SVBPQ8N300 66 aa-4.08□□□□□ -3.06
SNORD54-201ENST00000459159 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-4.1□□□□□ -3.07
SNORD54-201ENST00000459159 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-4.1□□□□□ -3.07
SNORD54-201ENST00000459159 K7ERU9 68 aa-4.1□□□□□ -3.07
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SNORD54-201ENST00000459159 SPA17Q15506 151 aa-4.12□□□□□ -3.07
SNORD54-201ENST00000459159 C9orf16Q9BUW7 83 aa-4.12□□□□□ -3.07
SNORD54-201ENST00000459159 AKAIN1P0CW23 69 aa-4.15□□□□□ -3.07
SNORD54-201ENST00000459159 STMN1P16949 149 aa-4.15□□□□□ -3.07
SNORD54-201ENST00000459159 J3QR89 54 aa-4.16□□□□□ -3.08
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SNORD54-201ENST00000459159 PYY3Q5JQD4 70 aa-4.16□□□□□ -3.08
SNORD54-201ENST00000459159 CENPXA8MT69 81 aa-4.2□□□□□ -3.08
SNORD54-201ENST00000459159 TPM4P67936 248 aa-4.21□□□□□ -3.08
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-4.23□□□□□ -3.09
SNORD54-201ENST00000459159 PET100P0DJ07 73 aa-4.24□□□□□ -3.09
SNORD54-201ENST00000459159 FAM25AB3EWG3 89 aa-4.26□□□□□ -3.09
SNORD54-201ENST00000459159 FAM25CB3EWG5 89 aa-4.26□□□□□ -3.09
SNORD54-201ENST00000459159 FAM25GB3EWG6 89 aa-4.26□□□□□ -3.09
SNORD54-201ENST00000459159 M0R143 59 aa-4.27□□□□□ -3.09
SNORD54-201ENST00000459159 Q9H521 79 aa-4.28□□□□□ -3.09
SNORD54-201ENST00000459159 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-4.31□□□□□ -3.1
SNORD54-201ENST00000459159 TOMM5Q8N4H5 51 aa-4.31□□□□□ -3.1
SNORD54-201ENST00000459159 TPM2P07951 284 aa-4.32□□□□□ -3.1
SNORD54-201ENST00000459159 TPM1P09493 284 aa-4.36□□□□□ -3.11
SNORD54-201ENST00000459159 PCP4L1A6NKN8 68 aa-4.4□□□□□ -3.11
SNORD54-201ENST00000459159 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-4.42□□□□□ -3.12
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GV90 55 aa-4.48□□□□□ -3.13
SNORD54-201ENST00000459159 TPM3P06753 285 aa-4.48□□□□□ -3.13
SNORD54-201ENST00000459159 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa-4.96□□□□□ -3.2
SNORD54-201ENST00000459159 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-4.98□□□□□ -3.21
SNORD54-201ENST00000459159 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP-4.99□□□□□ -3.21
SNORD54-201ENST00000459159 PTMSP20962 102 aa-5.46□□□□□ -3.28
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