RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ARID1B-231	ENST00000637887	PCOTH	Q58A44	107 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ARID1B-231	ENST00000637887	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ARID1B-231	ENST00000637887	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ARID1B-231	ENST00000637887	IGLV7-43	P04211	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ARID1B-231	ENST00000637887	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ARID1B-231	ENST00000637887	FBN3	Q75N90	2809 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887		Q96NJ1	140 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887		A0A1B0GU33	70 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	LY6G6C	O95867	125 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ARID1B-231	ENST00000637887	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887		A0A0G2JQZ4	141 aa		3	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		3	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887		Q6ZSA8	131 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		2.96	□□□□□ -1.93
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	LYST	Q99698	3801 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	SPINK1	P00995	79 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	TENM2	Q9NT68	2774 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887		H0YAA0	97 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	TPRXL	Q17RH7	258 aa		2.9	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH2	Q9P225	4427 aa		2.9	□□□□□ -1.94
ARID1B-231	ENST00000637887	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	CRIPT	Q9P021	101 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	TG	P01266	2768 aa		2.87	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	KMT2A	Q03164	3969 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP10-10	P60014	251 aa		2.84	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887	PLAC4	Q8WY50	150 aa		2.84	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887		R4GN34	69 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887	PKD1	P98161	4303 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887	DNHD1	Q96M86	4753 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887	INE1	O15225	51 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ARID1B-231	ENST00000637887	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887		Q5VSD8	79 aa		2.71	□□□□□ -1.97
ARID1B-231	ENST00000637887	C9orf92	A6NGG3	77 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ARID1B-231	ENST00000637887	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARID1B-231	ENST00000637887	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ARID1B-231	ENST00000637887	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARID1B-231	ENST00000637887	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ARID1B-231	ENST00000637887	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARID1B-231	ENST00000637887	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARID1B-231	ENST00000637887	PKHD1	P08F94	4074 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ARID1B-231	ENST00000637887		S4R3F8	94 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ARID1B-231	ENST00000637887	RYR2	Q92736	4967 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ARID1B-231	ENST00000637887	FAT1	Q14517	4588 aa		2.59	□□□□□ -2
ARID1B-231	ENST00000637887	MT1HL1	P0DM35	61 aa		2.58	□□□□□ -2
ARID1B-231	ENST00000637887	TNXB	P22105	4242 aa		2.56	□□□□□ -2
ARID1B-231	ENST00000637887	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		2.56	□□□□□ -2
ARID1B-231	ENST00000637887		A0A0D9SG42	100 aa		2.55	□□□□□ -2
ARID1B-231	ENST00000637887	HSPG2	P98160	4391 aa		2.54	□□□□□ -2
ARID1B-231	ENST00000637887	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ARID1B-231	ENST00000637887	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
ARID1B-231	ENST00000637887	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ARID1B-231	ENST00000637887	RYR1	P21817	5038 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ARID1B-231	ENST00000637887	RYR3	Q15413	4870 aa		2.51	□□□□□ -2.01
ARID1B-231	ENST00000637887	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		2.51	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.7 ms