RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	BCE1	O60756	84 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	NDUFA3	O95167	84 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SMIM13	P0DJ93	91 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	FCER1G	P30273	86 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SPINK7	P58062	85 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PRCD	Q00LT1	54 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	COX6A2	Q02221	97 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	COX17	Q14061	63 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LELP1	Q5T871	98 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	GAFA1	Q96PS6	74 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	NBAS	A2RRP1	2371 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CREBBP	Q92793	2442 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		A8MTW9	85 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		G3V318	75 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		H0Y9P7	68 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PLGLA	Q15195	96 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	KLK9	Q2XQG4	91 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CRIPT	Q9P021	101 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PRO0255	Q9UI72	69 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.28	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		0.28	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	F8	P00451	2351 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	ACACB	O00763	2458 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	MUC17	Q685J3	4493 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		K7EIL1	84 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		M0QY20	66 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	NDUFA1	O15239	70 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	PLN	P26678	52 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	ENHO	Q6UWT2	76 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00643	Q86TS7	51 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	PRO3102	Q9H379	93 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		Q9Y3F1	56 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	ACACA	Q13085	2346 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	ACAN	P16112	2415 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	LRP2	P98164	4655 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	SSPO	A2VEC9	5147 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A0D9SG42	100 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		K7EQZ3	153 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	ACYP1	P07311	99 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	ATXN8	Q156A1	80 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	NREP	Q16612	68 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		Q8IZM0	81 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	SPRR4	Q96PI1	79 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	APLN	Q9ULZ1	77 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	MUC2	Q02817	5179 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		H0YAA0	97 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB136	Q30KP8	78 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	NDUFA4	O00483	81 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	COX7B	P24311	80 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00158	P58513	81 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	USMG5	Q96IX5	58 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	USH2A	O75445	5202 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A096LPF7	62 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227		H3BUX3	64 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB4A	O15263	64 aa		0.23	□□□□□ -2.37

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