RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP3R1P63098 170 aa-6.9□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-6.9□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC37Q6PGP7 1564 aa-6.91□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RALGAPBQ86X10 1494 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PEA15Q15121 130 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RABAC1Q9UI14 185 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBP2P50120 134 aa-6.93□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRCA2P51587 3418 aa-6.94□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNG4P50150 75 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM11AP58511 58 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLI2P10070 1586 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKAP12Q02952 1782 aa-6.97□□□□□ -3.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-6.98□□□□□ -3.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS13AQ96RL7 3174 aa-7□□□□□ -3.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCC6O95255 1503 aa-7.01□□□□□ -3.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-7.01□□□□□ -3.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 DIP2AQ14689 1571 aa-7.01□□□□□ -3.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A1P23297 94 aa-7.02□□□□□ -3.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-7.04□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-7.06□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM203Q969S6 136 aa-7.06□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 C3P01024 1663 aa-7.06□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 LMO7Q8WWI1 1683 aa-7.06□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENHOQ6UWT2 76 aa-7.07□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 CORTO00230 105 aa-7.08□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFA2O43678 99 aa-7.09□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 MROH1Q8NDA8 1641 aa-7.09□□□□□ -3.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIAM1Q13009 1591 aa-7.1□□□□□ -3.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 DLEU1O43261 78 aa-7.12□□□□□ -3.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB114Q30KQ6 69 aa-7.13□□□□□ -3.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00643Q86TS7 51 aa-7.13□□□□□ -3.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-7.14□□□□□ -3.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-7.14□□□□□ -3.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-7.16□□□□□ -3.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2orf88Q9BSF0 95 aa-7.16□□□□□ -3.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEP162Q5TB80 1403 aa-7.18□□□□□ -3.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-7.19□□□□□ -3.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KDM5DQ9BY66 1539 aa-7.19□□□□□ -3.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-7.22□□□□□ -3.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSC22D3Q99576 134 aa-7.22□□□□□ -3.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCRIBQ14160 1630 aa-7.23□□□□□ -3.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM13P0DJ93 91 aa-7.23□□□□□ -3.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A087WXM4 84 aa-7.25□□□□□ -3.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB131AP59861 70 aa-7.27□□□□□ -3.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB133Q30KQ1 61 aa-7.29□□□□□ -3.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-7.3□□□□□ -3.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GYPAP02724 150 aa-7.31□□□□□ -3.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GV90 55 aa-7.32□□□□□ -3.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 MADDQ8WXG6 1647 aa-7.32□□□□□ -3.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A10P60903 97 aa-7.34□□□□□ -3.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB121Q5J5C9 76 aa-7.37□□□□□ -3.59
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-7.39□□□□□ -3.59
RNU6-871P-201ENST00000516122 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-7.39□□□□□ -3.59
RNU6-871P-201ENST00000516122 MROH2AA6NES4 1674 aa-7.39□□□□□ -3.59
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALS2Q96Q42 1657 aa-7.41□□□□□ -3.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 NMES1Q9C002 83 aa-7.41□□□□□ -3.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-7.41□□□□□ -3.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNG8Q9UK08 70 aa-7.43□□□□□ -3.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCMAPQ5T1S8 102 aa-7.47□□□□□ -3.61
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD52P31358 61 aa-7.48□□□□□ -3.61
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-7.52□□□□□ -3.61
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-7.52□□□□□ -3.61
RNU6-871P-201ENST00000516122 UTRNP46939 3433 aa-7.54□□□□□ -3.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS8Q8N3P4 1428 aa-7.54□□□□□ -3.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 PYY3Q5JQD4 70 aa-7.56□□□□□ -3.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 K7EMI3 77 aa-7.57□□□□□ -3.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-7.58□□□□□ -3.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-7.61□□□□□ -3.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTN1P15515 57 aa-7.62□□□□□ -3.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-7.62□□□□□ -3.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BUT2 72 aa-7.63□□□□□ -3.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYCP2Q9BX26 1530 aa-7.68□□□□□ -3.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BVH4 76 aa-7.68□□□□□ -3.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 M0R1W7 72 aa-7.68□□□□□ -3.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM2Q9BVW6 85 aa-7.7□□□□□ -3.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGN1P05114 100 aa-7.71□□□□□ -3.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-7.72□□□□□ -3.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A096LNI7 61 aa-7.73□□□□□ -3.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCC3O15438 1527 aa-7.73□□□□□ -3.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATXN8Q156A1 80 aa-7.77□□□□□ -3.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TDRG1Q3Y452 100 aa-7.77□□□□□ -3.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00587B1AMM8 73 aa-7.78□□□□□ -3.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 C14orf144Q96I85 54 aa-7.81□□□□□ -3.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNHG12Q9BXW3 62 aa-7.82□□□□□ -3.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGIPA6NJ69 53 aa-7.84□□□□□ -3.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFF3Q07654 80 aa-7.84□□□□□ -3.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-7.86□□□□□ -3.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCC1P33527 1531 aa-7.88□□□□□ -3.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCA8O94911 1581 aa-7.88□□□□□ -3.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A12P80511 92 aa-7.89□□□□□ -3.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-7.89□□□□□ -3.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-7.91□□□□□ -3.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PEG3Q9GZU2 1588 aa-7.91□□□□□ -3.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFCAB10A6NFE3 127 aa-7.93□□□□□ -3.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 M0R143 59 aa-7.93□□□□□ -3.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERF2P84101 59 aa-7.95□□□□□ -3.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms