RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384269.1

RNU6-842P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 842, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-842P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-842P-201ENST00000384269 VPS8Q8N3P4 1428 aa-3.72□□□□□ -3.01
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB121Q5J5C9 76 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-842P-201ENST00000384269 TTC37Q6PGP7 1564 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-842P-201ENST00000384269 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-842P-201ENST00000384269 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-842P-201ENST00000384269 MED14O60244 1454 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-842P-201ENST00000384269 S100A8P05109 93 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-842P-201ENST00000384269 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-842P-201ENST00000384269 CFAP54Q96N23 3096 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 V9GYS6 101 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABCC6O95255 1503 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 CLASP1Q7Z460 1538 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 MROH1Q8NDA8 1641 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABRACLQ9P1F3 81 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB114Q30KQ6 69 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-842P-201ENST00000384269 TDRG1Q3Y452 100 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 VPS13CQ709C8 3753 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 UACAQ9BZF9 1416 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 PREX2Q70Z35 1606 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 LEAP2Q969E1 77 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 C3P01024 1663 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB136Q30KP8 78 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 ST20Q9HBF5 79 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 DIP2AQ14689 1571 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 H3BUT2 72 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 ADIRFQ15847 76 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 KAAG1Q9UBP8 84 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-842P-201ENST00000384269 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-842P-201ENST00000384269 H3BVH4 76 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABCC1P33527 1531 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-842P-201ENST00000384269 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-842P-201ENST00000384269 PEG3Q9GZU2 1588 aa-3.97□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 KIF21BO75037 1637 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 CROCC2H7BZ55 1655 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 GLI2P10070 1586 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 MT1FP04733 61 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 MADDQ8WXG6 1647 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 TIAM1Q13009 1591 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 S100A13Q99584 98 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-842P-201ENST00000384269 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-842P-201ENST00000384269 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-842P-201ENST00000384269 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-842P-201ENST00000384269 SPEGQ15772 3267 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-842P-201ENST00000384269 ATXN8Q156A1 80 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-842P-201ENST00000384269 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-842P-201ENST00000384269 C18orf32Q8TCD1 76 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-842P-201ENST00000384269 DMDP11532 3685 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-842P-201ENST00000384269 K7EMI3 77 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-842P-201ENST00000384269 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-842P-201ENST00000384269 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-842P-201ENST00000384269 FRYLO94915 3013 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-842P-201ENST00000384269 PCNTO95613 3336 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-842P-201ENST00000384269 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-4.18□□□□□ -3.08
RNU6-842P-201ENST00000384269 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-842P-201ENST00000384269 GNG13Q9P2W3 67 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-842P-201ENST00000384269 ALS2Q96Q42 1657 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-842P-201ENST00000384269 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-842P-201ENST00000384269 M0R1W7 72 aa-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABCA8O94911 1581 aa-4.3□□□□□ -3.1
RNU6-842P-201ENST00000384269 NMES1Q9C002 83 aa-4.3□□□□□ -3.1
RNU6-842P-201ENST00000384269 CEP350Q5VT06 3117 aa-4.32□□□□□ -3.1
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB131AP59861 70 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-842P-201ENST00000384269 SERF2P84101 59 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-842P-201ENST00000384269 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-842P-201ENST00000384269 EEA1Q15075 1411 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-842P-201ENST00000384269 SZT2Q5T011 3432 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-842P-201ENST00000384269 LINC01549A6NIU2 74 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-842P-201ENST00000384269 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-842P-201ENST00000384269 CENPEQ02224 2701 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-842P-201ENST00000384269 GNG2P59768 71 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-842P-201ENST00000384269 CEP250Q9BV73 2442 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-842P-201ENST00000384269 MROH2AA6NES4 1674 aa-4.47□□□□□ -3.12
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABCA6Q8N139 1617 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-842P-201ENST00000384269 S100ZQ8WXG8 99 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-842P-201ENST00000384269 IGIPA6NJ69 53 aa-4.51□□□□□ -3.13
RNU6-842P-201ENST00000384269 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-4.51□□□□□ -3.13
RNU6-842P-201ENST00000384269 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-4.52□□□□□ -3.13
RNU6-842P-201ENST00000384269 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-842P-201ENST00000384269 H0YGX0 51 aa-4.55□□□□□ -3.14
RNU6-842P-201ENST00000384269 EP400Q96L91 3159 aa-4.57□□□□□ -3.14
RNU6-842P-201ENST00000384269 LMO7Q8WWI1 1683 aa-4.57□□□□□ -3.14
RNU6-842P-201ENST00000384269 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-4.58□□□□□ -3.14
RNU6-842P-201ENST00000384269 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-4.6□□□□□ -3.15
RNU6-842P-201ENST00000384269 SYCP2Q9BX26 1530 aa-4.6□□□□□ -3.15
RNU6-842P-201ENST00000384269 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-4.61□□□□□ -3.15
RNU6-842P-201ENST00000384269 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-4.61□□□□□ -3.15
RNU6-842P-201ENST00000384269 MUC3AQ02505 3323 aa-4.64□□□□□ -3.15
RNU6-842P-201ENST00000384269 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-4.68□□□□□ -3.16
RNU6-842P-201ENST00000384269 TFF3Q07654 80 aa-4.71□□□□□ -3.16
RNU6-842P-201ENST00000384269 SCRIBQ14160 1630 aa-4.72□□□□□ -3.17
RNU6-842P-201ENST00000384269 TTTY10Q9BZA0 68 aa-4.74□□□□□ -3.17
RNU6-842P-201ENST00000384269 AGLP35573 1532 aa-4.75□□□□□ -3.17
RNU6-842P-201ENST00000384269 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-4.76□□□□□ -3.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms