RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4C-211ENST00000597360 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4C-211ENST00000597360 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4C-211ENST00000597360 IGKV2-30P06310 120 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4C-211ENST00000597360 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4C-211ENST00000597360 SPRR1BP22528 89 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4C-211ENST00000597360 C14orf177Q52M58 125 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4C-211ENST00000597360 TENM2Q9NT68 2774 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4C-211ENST00000597360 RTL8CO15255 209 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4C-211ENST00000597360 Q96NJ1 140 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4C-211ENST00000597360 PANO1I0J062 215 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4C-211ENST00000597360 DNHD1Q96M86 4753 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4C-211ENST00000597360 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.18□□□□□ -0.94
PDE4C-211ENST00000597360 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PDE4C-211ENST00000597360 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4C-211ENST00000597360 CRIPTQ9P021 101 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4C-211ENST00000597360 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PDE4C-211ENST00000597360 DMAC1Q96GE9 116 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4C-211ENST00000597360 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4C-211ENST00000597360 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4C-211ENST00000597360 FAM229AH3BQW9 127 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4C-211ENST00000597360 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4C-211ENST00000597360 Q8N1X5 172 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4C-211ENST00000597360 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4C-211ENST00000597360 TGP01266 2768 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4C-211ENST00000597360 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF861PO60384 105 aa9□□□□□ -0.97
PDE4C-211ENST00000597360 SPACA4Q8TDM5 124 aa9□□□□□ -0.97
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4C-211ENST00000597360 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4C-211ENST00000597360 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PDE4C-211ENST00000597360 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4C-211ENST00000597360 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00483Q53H64 154 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4C-211ENST00000597360 IGLV7-43P04211 117 aa8.9□□□□□ -0.99
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4C-211ENST00000597360 K7ERS5 55 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4C-211ENST00000597360 APLNQ9ULZ1 77 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4C-211ENST00000597360 ROMO1P60602 79 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4C-211ENST00000597360 FBN3Q75N90 2809 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4C-211ENST00000597360 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.83□□□□□ -1
PDE4C-211ENST00000597360 LYSTQ99698 3801 aa8.83□□□□□ -1
PDE4C-211ENST00000597360 A0A087WTM6 91 aa8.82□□□□□ -1
PDE4C-211ENST00000597360 A0A1B0GU33 70 aa8.79□□□□□ -1
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 LY6G6CO95867 125 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 A8MUU9 505 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 Q6ZSA8 131 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 H0YAA0 97 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4C-211ENST00000597360 A0A0D9SG42 100 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4C-211ENST00000597360 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4C-211ENST00000597360 NUPR2A6NF83 97 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4C-211ENST00000597360 C9orf92A6NGG3 77 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4C-211ENST00000597360 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4C-211ENST00000597360 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4C-211ENST00000597360 KMT2AQ03164 3969 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4C-211ENST00000597360 NDUFAF8A1L188 74 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4C-211ENST00000597360 P0C880 135 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4C-211ENST00000597360 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4C-211ENST00000597360 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4C-211ENST00000597360 A0A0A0MQY5 61 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-211ENST00000597360 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-211ENST00000597360 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH2Q9P225 4427 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-2P60368 255 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-211ENST00000597360 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4C-211ENST00000597360 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4C-211ENST00000597360 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4C-211ENST00000597360 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4C-211ENST00000597360 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-1P60331 282 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4C-211ENST00000597360 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4C-211ENST00000597360 TPRXLQ17RH7 258 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4C-211ENST00000597360 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4C-211ENST00000597360 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4C-211ENST00000597360 PKD1P98161 4303 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4C-211ENST00000597360 RYR2Q92736 4967 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4C-211ENST00000597360 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.15□□□□□ -1.1
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.11□□□□□ -1.11
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