RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572557.5

AKAP1-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AKAP1, Length 3,098 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-208ENST00000572557 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.08□□□□□ -1.28
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AKAP1-208ENST00000572557 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.06□□□□□ -1.28
AKAP1-208ENST00000572557 COL6A5A8TX70 2615 aa7.05□□□□□ -1.28
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AKAP1-208ENST00000572557 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.32□□□□□ -1.4
AKAP1-208ENST00000572557 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
AKAP1-208ENST00000572557 KRTAP10-1P60331 282 aa6.26□□□□□ -1.41
AKAP1-208ENST00000572557 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.2□□□□□ -1.42
AKAP1-208ENST00000572557 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.19□□□□□ -1.42
AKAP1-208ENST00000572557 PKD1P98161 4303 aa6.19□□□□□ -1.42
AKAP1-208ENST00000572557 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.18□□□□□ -1.42
AKAP1-208ENST00000572557 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
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