RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479		J3KT08	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAL4	O96015	105 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	COX7C	P15954	63 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM258	P61165	79 aa		5	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	C5orf47	Q569G3	176 aa		5	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1H	P80294	61 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BQ85	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479		Q75L30	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WSZ3	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479		Q96NJ1	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479		M0R2T5	61 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PNM2	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BS24	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE6G	P18545	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CCK	P06307	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MUU9	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	DSCR10	P59022	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFC1	O43677	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00313	P59037	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	CXCL6	P80162	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KIFC3-231	ENST00000567479	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WVE0	104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GVX0	72 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZQT0	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GW54	56 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479		H7BZZ5	65 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFB1	O75438	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479	HRES1	P13985	223 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZVQ6	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KIFC3-231	ENST00000567479	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MWP4	228 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	SPINK7	P58062	85 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	NREP	Q16612	68 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	BPY2	O14599	106 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	MT2A	P02795	61 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479		V9GYY9	64 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1F	P04733	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KIFC3-231	ENST00000567479	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KIFC3-231	ENST00000567479	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms