RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 CASC2Q6XLA1 102 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TEN1Q86WV5 123 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 COA5Q86WW8 74 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SNX29P2Q8IUI4 249 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ATG5Q9H1Y0 275 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 F8W1H4 67 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CCDC179H3BU77 68 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 M0QY20 66 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 IGKCP01834 107 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 PYYP10082 97 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 LSM3P62310 102 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 MEIG1Q5JSS6 88 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 C2orf82Q6UX34 121 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 Q6ZUT4 128 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 C5orf17Q8NAS9 161 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 Q96NJ1 140 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 C12orf57Q99622 126 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SMIM7Q9BQ49 75 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SEC11CQ9BY50 192 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 NMES1Q9C002 83 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SAR1AQ9NR31 198 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 AP4S1Q9Y587 144 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 H3BRM9 83 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 NCR2O95944 276 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 AKAIN1P0CW23 69 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ADCYAP1P18509 176 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 KLKP1Q107X0 134 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 FAM74A1Q5RGS3 127 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CSAG1Q6PB30 78 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 KCNRGQ8N5I3 272 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TMEM191AQ9H0A3 160 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 MED9Q9NWA0 146 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ORMDL1Q9P0S3 153 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 A0A087WSZ3 146 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SNCGO76070 127 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 IAPPP10997 89 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 S100PP25815 95 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 PLAC4Q8WY50 150 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 C14orf144Q96I85 54 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CRIPTQ9P021 101 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 IFITM5A6NNB3 132 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SLC25A6P12236 298 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 COX7CP15954 63 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 GNG4P50150 75 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 UBE2G1P62253 170 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 LINC01545Q5VT33 79 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ATOH7Q8N100 152 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SPTSSBQ8NFR3 76 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 MGST2Q99735 147 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ZFP30Q9Y2G7 519 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ALKAL2Q6UX46 152 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 OR10AG1Q8NH19 301 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 IFI27L1Q96BM0 104 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 DSCR8Q96T75 97 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SERP1Q9Y6X1 66 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 F8VRH5 84 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 PDCD5O14737 125 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 NDUFB6O95139 128 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 MGPP08493 103 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SMIM6P0DI80 62 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 PDE6GP18545 87 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SPRR1AP35321 89 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 NPC2P61916 151 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SPANXN1Q5VSR9 72 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 Q8N8P6 123 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 COPS9Q8WXC6 57 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 PRO1933Q9H354 126 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SNURFQ9Y675 71 aa0.52□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 TMEM218A2RU14 115 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 CCKP06307 115 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 IFITM1P13164 125 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 CRIP1P50238 77 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SPINK7P58062 85 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 HSD52Q0P140 79 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 LINC00299Q6ZSB3 139 aa0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms