RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 A0A087WYN8 130 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV7-43P04211 117 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 ENHOQ6UWT2 76 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 LRP2P98164 4655 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFAF8A1L188 74 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 F8VRH5 84 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 I3L2K1 104 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 M0R3E3 92 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00315P59091 139 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 FXYD4P59646 89 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0J9YX75 114 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 I3L3M4 83 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 PRR34Q9NV39 138 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1B0GU33 70 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1-17P01599 117 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB130BP0DP73 79 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB130AP0DP74 79 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 COX7B2Q8TF08 81 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00208Q96KT6 92 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 IGIPA6NJ69 53 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 LCE1FQ5T754 118 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 PRCDQ00LT1 54 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 Q5W150 140 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 KLK12Q9UKR0 248 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 A0A087WTM6 91 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 UQCR11O14957 56 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 MGPP08493 103 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1B0GUV1 79 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 H0Y9P7 68 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 CCL18P55774 89 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 LITAFQ99732 161 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 TNXBP22105 4242 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 A0A096LPF7 62 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 HTN1P15515 57 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 PDE6GP18545 87 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 PDE6HQ13956 83 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 A8MTW9 85 aa3.28□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 H0YGX0 51 aa3.28□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 MT1HL1P0DM35 61 aa3.28□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 SPINK7P58062 85 aa3.28□□□□□ -1.88
TMOD3-209ENST00000561136 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.27□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 Q6ZTI0 123 aa3.27□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 SPRR4Q96PI1 79 aa3.27□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 LPAP08519 4548 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 Q6ZSA8 131 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 FAM168BA1KXE4 195 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF861PO60384 105 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 IAPPP10997 89 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 PRR9Q5T870 116 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-209ENST00000561136 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-209ENST00000561136 H3BRN7 92 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-209ENST00000561136 COX17Q14061 63 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-209ENST00000561136 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-209ENST00000561136 LELP1Q5T871 98 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms