RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.97□□□□□ -2.56
FAM227B-211ENST00000560557 DMDP11532 3685 aa-0.97□□□□□ -2.56
FAM227B-211ENST00000560557 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-0.97□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 LY75O60449 1722 aa-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 ITSN1Q15811 1721 aa-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 FANCAO15360 1455 aa-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 ATP10BO94823 1461 aa-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 DPY30Q9C005 99 aa-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.98□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 H3BUA1 57 aa-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFA4O00483 81 aa-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 CENPEQ02224 2701 aa-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 NCOA2Q15596 1464 aa-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.99□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 CFAP54Q96N23 3096 aa-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 DIP2BQ9P265 1576 aa-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 LINC01546A6NGU7 62 aa-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 GYPAP02724 150 aa-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC88BA6NC98 1476 aa-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 KIF1AQ12756 1690 aa-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 PPLO60437 1756 aa-1.01□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 SPEGQ15772 3267 aa-1.02□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 C20orf78Q9BR46 151 aa-1.02□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.02□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.03□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.03□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 M0QZ58 72 aa-1.03□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB4AO15263 64 aa-1.03□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.03□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 NREPQ16612 68 aa-1.03□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
FAM227B-211ENST00000560557 TJP1Q07157 1748 aa-1.03□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 NRAPQ86VF7 1730 aa-1.03□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-1.03□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.04□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 M0QY20 66 aa-1.04□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 RBP2P50120 134 aa-1.04□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 CRIP1P50238 77 aa-1.04□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.04□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 UBL5Q9BZL1 73 aa-1.04□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1B0GUL6 1792 aa-1.04□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.05□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 HFM1A2PYH4 1435 aa-1.05□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 FCER1GP30273 86 aa-1.05□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-1.05□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 C6orf48Q9UBA6 75 aa-1.05□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.05□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 RICTORQ6R327 1708 aa-1.06□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 A0A087WXM4 84 aa-1.06□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.06□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 SFTA3P0C7M3 94 aa-1.06□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 NCMAPQ5T1S8 102 aa-1.06□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 VPS13CQ709C8 3753 aa-1.06□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.06□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.06□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-1.07□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 A8MTW9 85 aa-1.07□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 MT1FP04733 61 aa-1.07□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 PYY3Q5JQD4 70 aa-1.07□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.07□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.07□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-1.07□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 SMARCA2P51531 1590 aa-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 CEP350Q5VT06 3117 aa-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 AKAP12Q02952 1782 aa-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 M0R143 59 aa-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 C14orf144Q96I85 54 aa-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 RALGAPBQ86X10 1494 aa-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-1.09□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-1.09□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-1.09□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 ERVK-7P63135 1459 aa-1.09□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-1.09□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.09□□□□□ -2.58
FAM227B-211ENST00000560557 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms