RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 J3KT08 172 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 NREPQ16612 68 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 UBL5Q9BZL1 73 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 K7ERU9 68 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 C1orf195Q5TG92 126 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 MYCBP2O75592 4640 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 NDUFB1O75438 58 aa5.29□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 Q6ZVQ6 151 aa5.29□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 LINC00846Q9NV44 126 aa5.29□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 BPY2O14599 106 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 SIGMAR1Q99720 223 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-220ENST00000550700 IGKV4-1P06312 121 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 CXCL6P80162 114 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 LINC00643Q86TS7 51 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 Q96NJ1 140 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 TNXBP22105 4242 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 A8MWP4 228 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 PRR4Q16378 134 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 C8orf87E5RJ46 101 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GVX0 72 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 PRR15Q8IV56 129 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 TPRXLQ17RH7 258 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 DSCR10P59022 87 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 LINC00313P59037 77 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 IMUPQ9GZP8 106 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 CDIP1Q9H305 208 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 PCP4P48539 62 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-220ENST00000550700 K7EQZ3 153 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 hDV103S1A0JD37 113 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 HCG22E2RYF7 251 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 CASC2Q6XLA1 102 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 C9orf92A6NGG3 77 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 Q8N9L7 120 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 Q75L30 129 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-220ENST00000550700 A8MUU9 505 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 MT-ATP8P03928 68 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 NDUFS5O43920 106 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 SCGB1A1P11684 91 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-220ENST00000550700 HERC1Q15751 4861 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-220ENST00000550700 A0A087WVE0 104 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-220ENST00000550700 UQCRQO14949 82 aa5□□□□□ -1.61
CS-220ENST00000550700 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CS-220ENST00000550700 ATOX1O00244 68 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-220ENST00000550700 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-220ENST00000550700 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-220ENST00000550700 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-220ENST00000550700 C5orf47Q569G3 176 aa4.96□□□□□ -1.62
CS-220ENST00000550700 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.96□□□□□ -1.62
CS-220ENST00000550700 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-220ENST00000550700 PCOTHQ58A44 107 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-220ENST00000550700 OCR1Q9BZK8 76 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-220ENST00000550700 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-220ENST00000550700 H3BPC8 53 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-220ENST00000550700 MP68P56378 58 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-220ENST00000550700 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.91□□□□□ -1.62
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CS-220ENST00000550700 Q5W150 140 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 SERP2Q8N6R1 65 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 LRP2P98164 4655 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 LPAP08519 4548 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 SPINK7P58062 85 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 IGKV2-30P06310 120 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 LINC00208Q96KT6 92 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-220ENST00000550700 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.84□□□□□ -1.63
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