RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517278.1

RNU6-1174P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1174, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1174P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SMIM3Q9BZL3 60 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 M0R2Z0 102 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 S100A8P05109 93 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SPANXCQ9NY87 97 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RICTORQ6R327 1708 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MYOM2P54296 1465 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MPC2O95563 127 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 S100GP29377 79 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KRTDAPP60985 99 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PLGLAQ15195 96 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TRIQKQ629K1 86 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 OOSP1A8MZH6 123 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NDUFB1O75438 58 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 COPZ1P61923 177 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KAAG1Q9UBP8 84 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FAM24AA6NFZ4 105 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 H3BQ15 152 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PCBD2Q9H0N5 130 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HSPB11Q9Y547 144 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ABCA3Q99758 1704 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FAM107BQ9H098 131 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ABRACLQ9P1F3 81 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CCDC88BA6NC98 1476 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 LINC00032P0C843 101 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DR1Q01658 176 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GID8Q9NWU2 228 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MEIG1Q5JSS6 88 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PFDN5Q99471 154 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ARHGAP5Q13017 1502 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 hADV29S1A0JD25 119 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HFM1A2PYH4 1435 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ATOX1O00244 68 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TSTD1Q8NFU3 115 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DPY30Q9C005 99 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FOCADQ5VW36 1801 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 UMAD1C9J7I0 102 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 LZICQ8WZA0 190 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 UBL5Q9BZL1 73 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NAIPQ13075 1403 aa-3.47□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NHSQ6T4R5 1651 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 A0A1B0GV72 72 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SPANXA1Q9NS26 97 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FANCAO15360 1455 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 UTRNP46939 3433 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DDA1Q9BW61 102 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ARPC4P59998 168 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DEFB133Q30KQ1 61 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TTC37Q6PGP7 1564 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RBP2P50120 134 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CKS1BP61024 79 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-1174P-201ENST00000517278 C3P01024 1663 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NREPQ16612 68 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CD52P31358 61 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FAM25AB3EWG3 89 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FAM25CB3EWG5 89 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FAM25GB3EWG6 89 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SVBPQ8N300 66 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CENPHQ9H3R5 247 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RALGAPBQ86X10 1494 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 LMO7Q8WWI1 1683 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GLI2P10070 1586 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DIP2AQ14689 1571 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GNGT2O14610 69 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 G0S2P27469 103 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SELENOWP63302 87 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PYDC1Q8WXC3 89 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-1174P-201ENST00000517278 E5RI56 91 aa-3.59□□□□□ -2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms