RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 Q6Q795 121 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZQT0 140 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-211ENST00000497210 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-211ENST00000497210 SPINK1P00995 79 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-211ENST00000497210 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-211ENST00000497210 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-211ENST00000497210 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-211ENST00000497210 J3QR89 54 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-211ENST00000497210 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP10-8P60410 259 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PNM2 257 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 TNXBP22105 4242 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WSZ3 146 aa5.61□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.61□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 MT1HL1P0DM35 61 aa5.61□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0G2JQZ4 141 aa5.6□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 ACYP1P07311 99 aa5.6□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 Q5XG85 94 aa5.6□□□□□ -1.51
CTPS1-211ENST00000497210 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.58□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 UBL5Q9BZL1 73 aa5.58□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 K7ERU9 68 aa5.57□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 NREPQ16612 68 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 J3KT08 172 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 SIGMAR1Q99720 223 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-211ENST00000497210 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZVQ6 151 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00846Q9NV44 126 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 BPY2O14599 106 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFB1O75438 58 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV4-1P06312 121 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf195Q5TG92 126 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 Q96NJ1 140 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 CXCL6P80162 114 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00643Q86TS7 51 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-211ENST00000497210 A8MWP4 228 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 PRR4Q16378 134 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GVX0 72 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 C8orf87E5RJ46 101 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.41□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 TPRXLQ17RH7 258 aa5.41□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 PRR15Q8IV56 129 aa5.41□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.4□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 K7EQZ3 153 aa5.4□□□□□ -1.54
CTPS1-211ENST00000497210 DSCR10P59022 87 aa5.39□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00313P59037 77 aa5.37□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 HERC1Q15751 4861 aa5.37□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf92A6NGG3 77 aa5.36□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.36□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 Q8N9L7 120 aa5.36□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.36□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 HCG22E2RYF7 251 aa5.35□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 PRAC1Q96KF2 57 aa5.35□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 IMUPQ9GZP8 106 aa5.35□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.34□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 hDV103S1A0JD37 113 aa5.34□□□□□ -1.55
CTPS1-211ENST00000497210 CASC2Q6XLA1 102 aa5.33□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.33□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.32□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 MT-ATP8P03928 68 aa5.31□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.31□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.3□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFS5O43920 106 aa5.29□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WVE0 104 aa5.28□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.28□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.28□□□□□ -1.56
CTPS1-211ENST00000497210 MT3P25713 68 aa5.26□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 A8MUU9 505 aa5.25□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 SCGB1A1P11684 91 aa5.25□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.25□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 LPAP08519 4548 aa5.24□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.24□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.24□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.24□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.22□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 LRP2P98164 4655 aa5.21□□□□□ -1.57
CTPS1-211ENST00000497210 ATOX1O00244 68 aa5.21□□□□□ -1.58
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.21□□□□□ -1.58
CTPS1-211ENST00000497210 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CTPS1-211ENST00000497210 UQCRQO14949 82 aa5.19□□□□□ -1.58
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.17□□□□□ -1.58
CTPS1-211ENST00000497210 PCOTHQ58A44 107 aa5.16□□□□□ -1.58
CTPS1-211ENST00000497210 MP68P56378 58 aa5.15□□□□□ -1.59
CTPS1-211ENST00000497210 OCR1Q9BZK8 76 aa5.15□□□□□ -1.59
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.14□□□□□ -1.59
CTPS1-211ENST00000497210 MUC17Q685J3 4493 aa5.13□□□□□ -1.59
CTPS1-211ENST00000497210 H0Y9P7 68 aa5.12□□□□□ -1.59
CTPS1-211ENST00000497210 C5orf47Q569G3 176 aa5.12□□□□□ -1.59
CTPS1-211ENST00000497210 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.12□□□□□ -1.59
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