RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-1.53□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 CSMD2Q7Z408 3487 aa-1.53□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-1.53□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-1.53□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 TNP1P09430 55 aa-1.54□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 MT1GP13640 62 aa-1.54□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 PPLO60437 1756 aa-1.54□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-1.55□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 NCOA2Q15596 1464 aa-1.55□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.55□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 ACYP1P07311 99 aa-1.55□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.55□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 TJP1Q07157 1748 aa-1.56□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 IAPPP10997 89 aa-1.56□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 MT1MQ8N339 61 aa-1.56□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 KIF1AQ12756 1690 aa-1.57□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-1.57□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 MT2AP02795 61 aa-1.57□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.57□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.57□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 LCE6AA0A183 80 aa-1.58□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 IFI6P09912 130 aa-1.58□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.59□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 A0A1B0GUL6 1792 aa-1.59□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-1.59□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 NDUFB1O75438 58 aa-1.59□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 MT1BP07438 61 aa-1.59□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-1.59□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
PTEN-204ENST00000487939 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.6□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.6□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 VPS8Q8N3P4 1428 aa-1.6□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 NRAPQ86VF7 1730 aa-1.6□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-1.6□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-1.61□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 PKIAP61925 76 aa-1.61□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-1.61□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.62□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 FREM2Q5SZK8 3169 aa-1.62□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 KIF14Q15058 1648 aa-1.62□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1.63□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-1.64□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.64□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 RICTORQ6R327 1708 aa-1.64□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-1.64□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 S100A8P05109 93 aa-1.65□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-1.65□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 SMARCA2P51531 1590 aa-1.65□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.65□□□□□ -2.67
PTEN-204ENST00000487939 CCDC88BA6NC98 1476 aa-1.66□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.66□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.66□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 NDUFA4O00483 81 aa-1.67□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 WT1-ASQ06250 92 aa-1.67□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 ABCC3O15438 1527 aa-1.67□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-1.68□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.68□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-1.68□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 PYY3Q5JQD4 70 aa-1.68□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 NHSQ6T4R5 1651 aa-1.68□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 Q9H521 79 aa-1.69□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 LINC01546A6NGU7 62 aa-1.7□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-1.71□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-1.72□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 NREPQ16612 68 aa-1.72□□□□□ -2.68
PTEN-204ENST00000487939 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-1.73□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 H3BUA1 57 aa-1.75□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 DEFB4AO15263 64 aa-1.75□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 V9GYS6 101 aa-1.75□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 ERVK-7P63135 1459 aa-1.75□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-1.77□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.77□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 CFAP54Q96N23 3096 aa-1.77□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 HFM1A2PYH4 1435 aa-1.77□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 TTC37Q6PGP7 1564 aa-1.77□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 M0QY20 66 aa-1.78□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 M0QZ58 72 aa-1.78□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.78□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-1.78□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
PTEN-204ENST00000487939 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 MROH1Q8NDA8 1641 aa-1.79□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-1.79□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.79□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-1.79□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.79□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 VPS13CQ709C8 3753 aa-1.79□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 A0A087WXM4 84 aa-1.8□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.81□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms