RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424636.2

TRDMT1-204, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRDMT1, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-204ENST00000424636 HMGN1P05114 100 aa-1.49□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 WT1-ASQ06250 92 aa-1.49□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 TMEM203Q969S6 136 aa-1.49□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM107BQ9H098 131 aa-1.49□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 VPS13CQ709C8 3753 aa-1.49□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 CCDC88BA6NC98 1476 aa-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 NCOA2Q15596 1464 aa-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 ACYP1P07311 99 aa-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 FAUP35544 74 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 NDUFB1O75438 58 aa-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 GNG8Q9UK08 70 aa-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 SMARCA2P51531 1590 aa-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-1.53□□□□□ -2.65
TRDMT1-204ENST00000424636 A0A1B0GUL6 1792 aa-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 EFCAB10A6NFE3 127 aa-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 NDUFA4O00483 81 aa-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 NRAPQ86VF7 1730 aa-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 LINC00032P0C843 101 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 SMIM11AP58511 58 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 PEA15Q15121 130 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 RICTORQ6R327 1708 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 C20orf202A1L168 122 aa-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 LINC01546A6NGU7 62 aa-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 DEFB4AO15263 64 aa-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 S100A10P60903 97 aa-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 DPY30Q9C005 99 aa-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 H3BUA1 57 aa-1.58□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 C20orf78Q9BR46 151 aa-1.58□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 PPLO60437 1756 aa-1.58□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.59□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 M0QZ58 72 aa-1.59□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 CRIP1P50238 77 aa-1.59□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.59□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 NHSQ6T4R5 1651 aa-1.59□□□□□ -2.66
TRDMT1-204ENST00000424636 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-1.6□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 GYPAP02724 150 aa-1.6□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 AKAP12Q02952 1782 aa-1.6□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-1.6□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 RBP2P50120 134 aa-1.61□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 NREPQ16612 68 aa-1.61□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.61□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.61□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.61□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-1.61□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-1.62□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.62□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 DMDP11532 3685 aa-1.62□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.62□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 M0QY20 66 aa-1.62□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.62□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 C14orf144Q96I85 54 aa-1.62□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 MED14O60244 1454 aa-1.63□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 FRYLO94915 3013 aa-1.63□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 HFM1A2PYH4 1435 aa-1.63□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 S100PP25815 95 aa-1.63□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 ERVK-7P63135 1459 aa-1.63□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-1.64□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 SPEGQ15772 3267 aa-1.64□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 A8MTW9 85 aa-1.64□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 C6orf48Q9UBA6 75 aa-1.64□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 KIF14Q15058 1648 aa-1.65□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 MT1FP04733 61 aa-1.65□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 SFTA3P0C7M3 94 aa-1.65□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.65□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 UBL5Q9BZL1 73 aa-1.65□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 RALGAPBQ86X10 1494 aa-1.65□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-1.66□□□□□ -2.67
TRDMT1-204ENST00000424636 NCMAPQ5T1S8 102 aa-1.66□□□□□ -2.68
TRDMT1-204ENST00000424636 PCNTO95613 3336 aa-1.67□□□□□ -2.68
TRDMT1-204ENST00000424636 FCER1GP30273 86 aa-1.67□□□□□ -2.68
TRDMT1-204ENST00000424636 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.67□□□□□ -2.68
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