RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 COL6A5A8TX70 2615 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 A8MUU9 505 aa5.66□□□□□ -1.5
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TMOD1-203ENST00000395211 MAST4O15021 2626 aa5.65□□□□□ -1.5
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TMOD1-203ENST00000395211 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.65□□□□□ -1.51
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TMOD1-203ENST00000395211 IGKV2-30P06310 120 aa5.62□□□□□ -1.51
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TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.56□□□□□ -1.52
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TMOD1-203ENST00000395211 APLNQ9ULZ1 77 aa5.24□□□□□ -1.57
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TMOD1-203ENST00000395211 C9orf92A6NGG3 77 aa5.11□□□□□ -1.59
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TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.9□□□□□ -1.63
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TMOD1-203ENST00000395211 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.9□□□□□ -1.63
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TMOD1-203ENST00000395211 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 XP32Q5T750 250 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 LCE2BO14633 110 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP12-1P59990 96 aa4.86□□□□□ -1.63
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