RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 LINC00575Q6W349 94 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 H3BUX3 64 aa3.76□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.75□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 PLAC4Q8WY50 150 aa3.75□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.74□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 K7EIL1 84 aa3.73□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.71□□□□□ -1.81
RRN3-202ENST00000327307 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.71□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 DSCR10P59022 87 aa3.7□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-11P60412 298 aa3.7□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.7□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 MINOS1Q5TGZ0 78 aa3.7□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 RYR2Q92736 4967 aa3.69□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.69□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 CRIPTQ9P021 101 aa3.69□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-8P60410 259 aa3.68□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.68□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 K7EQZ3 153 aa3.68□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.68□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.67□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.67□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 LEAP2Q969E1 77 aa3.66□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 I3L2K1 104 aa3.66□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.66□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.66□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 TENM2Q9NT68 2774 aa3.65□□□□□ -1.82
RRN3-202ENST00000327307 WT1-ASQ06250 92 aa3.65□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.65□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 LYSTQ99698 3801 aa3.65□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.65□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 PCOTHQ58A44 107 aa3.64□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.63□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.62□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.62□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 DEFB136Q30KP8 78 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 IGFL1Q6UW32 110 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-202ENST00000327307 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 H0YAA0 97 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 M0QY20 66 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP12-2P59991 146 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 PP632Q6XCG6 107 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 COX6A2Q02221 97 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 HERC2O95714 4834 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 K7EIM0 57 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 APELAP0DMC3 54 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-202ENST00000327307 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 H3BUA1 57 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.51□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.51□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.51□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 PRR9Q5T870 116 aa3.5□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 USMG5Q96IX5 58 aa3.5□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.49□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 KMT2AQ03164 3969 aa3.49□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 RYR1P21817 5038 aa3.49□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.49□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.48□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 Q6ZSA8 131 aa3.48□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.47□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 LCE3BQ5TA77 95 aa3.47□□□□□ -1.85
RRN3-202ENST00000327307 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.46□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.46□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 KLK9Q2XQG4 91 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 PKHD1P08F94 4074 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 DEFB135Q30KP9 77 aa3.42□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-2P60368 255 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 LELP1Q5T871 98 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
RRN3-202ENST00000327307 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.4□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DNAH2Q9P225 4427 aa3.4□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms