RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 Q5VSD8 79 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 Q6ZQY7 126 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 SPRR4Q96PI1 79 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 HERC2O95714 4834 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 SERP2Q8N6R1 65 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-202ENST00000317118 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 Q8N377 158 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-202ENST00000317118 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-202ENST00000317118 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.54□□□□□ -1.84
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PDE4D-202ENST00000317118 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.53□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.53□□□□□ -1.85
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PDE4D-202ENST00000317118 A6NN06 94 aa3.5□□□□□ -1.85
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PDE4D-202ENST00000317118 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 F8WEM9 126 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.49□□□□□ -1.85
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PDE4D-202ENST00000317118 Q8NBF4 154 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 CXCL6P80162 114 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 A0A087X002 238 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 H7BZZ5 65 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 PDE6GP18545 87 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-202ENST00000317118 LINC00643Q86TS7 51 aa3.47□□□□□ -1.85
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PDE4D-202ENST00000317118 KRTAP10-8P60410 259 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 TNXBP22105 4242 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1B0GW54 56 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 MOBPQ13875 183 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 IGFL1Q6UW32 110 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 Q6ZQT0 140 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-202ENST00000317118 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
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PDE4D-202ENST00000317118 MYCBP2O75592 4640 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 SPINK1P00995 79 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 MT1HL1P0DM35 61 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 C20orf197Q8N268 126 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.42□□□□□ -1.86
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PDE4D-202ENST00000317118 PRAC1Q96KF2 57 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-202ENST00000317118 A0A0G2JQZ4 141 aa3.4□□□□□ -1.86
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PDE4D-202ENST00000317118 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 KLKP1Q107X0 134 aa3.39□□□□□ -1.87
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PDE4D-202ENST00000317118 A0A087WSZ3 146 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 NDUFC1O43677 76 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 HCG22E2RYF7 251 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 LINC00846Q9NV44 126 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 NREPQ16612 68 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 UBL5Q9BZL1 73 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-202ENST00000317118 Q96NJ1 140 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-202ENST00000317118 A0A087WVE0 104 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 Q5VV11 94 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 BPY2O14599 106 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 A6NED7 52 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 IGKV4-1P06312 121 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 SNURFQ9Y675 71 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 LUZP6Q538Z0 58 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 A8MWP4 228 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 DSCR10P59022 87 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-202ENST00000317118 ROMO1P60602 79 aa3.3□□□□□ -1.88
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