RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2-30P06310 120 aa8.85□□□□□ -0.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSAG1Q6PB30 78 aa8.85□□□□□ -0.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 LYSTQ99698 3801 aa8.84□□□□□ -0.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZR54 194 aa8.84□□□□□ -0.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 C14orf177Q52M58 125 aa8.83□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 TGP01266 2768 aa8.83□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q96NJ1 140 aa8.82□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR1BP22528 89 aa8.82□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RTL8CO15255 209 aa8.82□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 UQCR11O14957 56 aa8.8□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.8□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.79□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-201ENST00000300213 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRIPTQ9P021 101 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-201ENST00000300213 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N1X5 172 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM229AH3BQW9 127 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 DMAC1Q96GE9 116 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF861PO60384 105 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBN3Q75N90 2809 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-201ENST00000300213 APLNQ9ULZ1 77 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00483Q53H64 154 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A087WTM6 91 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 LY6G6CO95867 125 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV7-43P04211 117 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 K7ERS5 55 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1B0GU33 70 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUPR2A6NF83 97 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 ROMO1P60602 79 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf92A6NGG3 77 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZSA8 131 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 H0YAA0 97 aa8.27□□□□□ -1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0D9SG42 100 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 A8MUU9 505 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 KMT2AQ03164 3969 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.17□□□□□ -1.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.16□□□□□ -1.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.15□□□□□ -1.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-2P60368 255 aa8.14□□□□□ -1.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.13□□□□□ -1.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.11□□□□□ -1.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.07□□□□□ -1.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 P0C880 135 aa8.04□□□□□ -1.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.04□□□□□ -1.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.03□□□□□ -1.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDUFAF8A1L188 74 aa8.02□□□□□ -1.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH3Q8TD57 4116 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-1P60331 282 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH2Q9P225 4427 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.91□□□□□ -1.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNHD1Q96M86 4753 aa7.91□□□□□ -1.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.89□□□□□ -1.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 TPRXLQ17RH7 258 aa7.84□□□□□ -1.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.78□□□□□ -1.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.74□□□□□ -1.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.73□□□□□ -1.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.69□□□□□ -1.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAT1Q14517 4588 aa7.69□□□□□ -1.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.69□□□□□ -1.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.68□□□□□ -1.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 S4R3F8 94 aa7.65□□□□□ -1.19
CCNDBP1-201ENST00000300213 PKHD1P08F94 4074 aa7.62□□□□□ -1.19
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYCBP2O75592 4640 aa7.61□□□□□ -1.19
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP12-2P59991 146 aa7.58□□□□□ -1.2
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