RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 LIMD2Q9BT23 127 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 ANK2Q01484 3957 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 CD164Q04900 197 aa7.44□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.43□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.42□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.41□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
UBXN4-201ENST00000272638 FAM229AH3BQW9 127 aa7.38□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 ACYP2P14621 99 aa7.38□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.38□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 A8MU10 97 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00483Q53H64 154 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 C8orf87E5RJ46 101 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 Q5W150 140 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 Q8N1X5 172 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN4-201ENST00000272638 HRES1P13985 223 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GU69 56 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN4-201ENST00000272638 Q1T7F1 81 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN4-201ENST00000272638 LCE6AA0A183 80 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-201ENST00000272638 Q5VV11 94 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN4-201ENST00000272638 LYSTQ99698 3801 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN4-201ENST00000272638 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.21□□□□□ -1.25
UBXN4-201ENST00000272638 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.2□□□□□ -1.26
UBXN4-201ENST00000272638 SPINK7P58062 85 aa7.19□□□□□ -1.26
UBXN4-201ENST00000272638 PRAC1Q96KF2 57 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-201ENST00000272638 DNHD1Q96M86 4753 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN4-201ENST00000272638 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN4-201ENST00000272638 Q75L30 129 aa7.1□□□□□ -1.27
UBXN4-201ENST00000272638 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
UBXN4-201ENST00000272638 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.09□□□□□ -1.27
UBXN4-201ENST00000272638 LCA10Q71F78 164 aa7.09□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 UQCR11O14957 56 aa7.08□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.08□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.08□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.07□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.06□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.06□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZSA8 131 aa7.05□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.04□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 DMAC1Q96GE9 116 aa7.04□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN4-201ENST00000272638 KMT2AQ03164 3969 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN4-201ENST00000272638 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN4-201ENST00000272638 K7ERS5 55 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN4-201ENST00000272638 Q5VSD8 79 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN4-201ENST00000272638 CRIPTQ9P021 101 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN4-201ENST00000272638 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0D9SG42 100 aa6.95□□□□□ -1.3
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.93□□□□□ -1.3
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.88□□□□□ -1.31
UBXN4-201ENST00000272638 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.87□□□□□ -1.31
UBXN4-201ENST00000272638 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.86□□□□□ -1.31
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GU33 70 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-201ENST00000272638 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.84□□□□□ -1.32
UBXN4-201ENST00000272638 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.83□□□□□ -1.32
UBXN4-201ENST00000272638 FAT1Q14517 4588 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN4-201ENST00000272638 J3QL48 77 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN4-201ENST00000272638 LINC01554Q52M75 96 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN4-201ENST00000272638 CSAG1Q6PB30 78 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH2Q9P225 4427 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 H3BS24 57 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 A6NN06 94 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.73□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 A8MUU9 505 aa6.72□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.72□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
UBXN4-201ENST00000272638 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GVY2 172 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-201ENST00000272638 S4R3F8 94 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-201ENST00000272638 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-201ENST00000272638 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN4-201ENST00000272638 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN4-201ENST00000272638 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-201ENST00000272638 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
UBXN4-201ENST00000272638 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN4-201ENST00000272638 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-201ENST00000272638 XP32Q5T750 250 aa6.59□□□□□ -1.36
UBXN4-201ENST00000272638 MYCBP2O75592 4640 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN4-201ENST00000272638 PKHD1P08F94 4074 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-201ENST00000272638 H0YAA0 97 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP10-8P60410 259 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
UBXN4-201ENST00000272638 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms