RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 LINC00587B1AMM8 73 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 H3BQ85 93 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 M0R378 163 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 NCR3O14931 201 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLNP26678 52 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 Q8NDZ9 215 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 DPM2O94777 84 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 COLCA2A8K830 154 aa4.1□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 LEPROTO15243 131 aa4.1□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.1□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 S100A12P80511 92 aa4.1□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.1□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 LPAP08519 4548 aa4.1□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 J3QQQ9 107 aa4.09□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGKCP01834 107 aa4.09□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.09□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.09□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.09□□□□□ -1.75
PDE4DIP-241ENST00000616206 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.08□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 SSPOA2VEC9 5147 aa4.08□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.08□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.07□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 NPC2P61916 151 aa4.07□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.07□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.07□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.06□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.06□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 TSTD3H0UI37 97 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BKO60814 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BJP06899 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BOP23527 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BBP33778 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BDP58876 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BCP62807 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPRR4Q96PI1 79 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.05□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.03□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 KRTDAPP60985 99 aa4.03□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.03□□□□□ -1.76
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.02□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A1B0GW54 56 aa4.02□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF815PA8K554 130 aa4.02□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 NDUFC2O95298 119 aa4.02□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPRR1AP35321 89 aa4.02□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.02□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 C20orf202A1L168 122 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 ERC2-IT1O76042 136 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGLV6-57P01721 117 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 MOBPQ13875 183 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 LINC01545Q5VT33 79 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 A8MU10 97 aa4□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 C3orf79P0CE67 100 aa4□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 C9orf153Q5TBE3 101 aa4□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPINT4Q6UDR6 99 aa4□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 Q6ZRX8 168 aa4□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 TIMM17BO60830 172 aa3.99□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 Q6Q795 121 aa3.99□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATOH7Q8N100 152 aa3.99□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 Q9BRP9 147 aa3.99□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPANXCQ9NY87 97 aa3.99□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPINK1P00995 79 aa3.98□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.97□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.97□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.97□□□□□ -1.77
PDE4DIP-241ENST00000616206 COX7BP24311 80 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 COPS9Q8WXC6 57 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 TPRXLQ17RH7 258 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 NEBP20929 6669 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 AKR1D1P51857 326 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A1B0GU33 70 aa3.93□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 IFITM1P13164 125 aa3.93□□□□□ -1.78
PDE4DIP-241ENST00000616206 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms