RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 H7BZZ5 65 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00167Q96N53 147 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 PRYO14603 147 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf25Q5T742 122 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 PANO1I0J062 215 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 CDK2AP2O75956 126 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00313P59037 77 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 C15orf56Q8N910 161 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGEF1-209ENST00000607882 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFS5O43920 106 aa7.99□□□□□ -1.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV6-57P01721 117 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.97□□□□□ -1.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 C14orf177Q52M58 125 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZQT0 140 aa7.96□□□□□ -1.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.96□□□□□ -1.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 PSPHP1O15172 72 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-209ENST00000607882 DIRC1Q969H9 104 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-209ENST00000607882 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.92□□□□□ -1.14
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RABGEF1-209ENST00000607882 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
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RABGEF1-209ENST00000607882 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-209ENST00000607882 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-209ENST00000607882 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.9□□□□□ -1.14
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RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZRP5 223 aa7.84□□□□□ -1.16
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RABGEF1-209ENST00000607882 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-209ENST00000607882 Q75L30 129 aa7.76□□□□□ -1.17
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RABGEF1-209ENST00000607882 Q1T7F1 81 aa7.75□□□□□ -1.17
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RABGEF1-209ENST00000607882 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-209ENST00000607882 C7orf33Q8WU49 177 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-209ENST00000607882 HCG22E2RYF7 251 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-209ENST00000607882 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.71□□□□□ -1.17
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