RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PKHD1P08F94 4074 aa13.92□□□□□ -0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa13.89□□□□□ -0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GW54 56 aa13.89□□□□□ -0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZQT0 140 aa13.89□□□□□ -0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6JHZ5 121 aa13.85□□□□□ -0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRR4Q96PI1 79 aa13.84□□□□□ -0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 UBL5Q9BZL1 73 aa13.82□□□□□ -0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa13.8□□□□□ -0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
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CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM29Q86T20 159 aa13.8□□□□□ -0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 FAT2Q9NYQ8 4349 aa13.79□□□□□ -0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 C3orf22Q8N5N4 141 aa13.79□□□□□ -0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 SIGMAR1Q99720 223 aa13.79□□□□□ -0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAH11Q96DT5 4516 aa13.79□□□□□ -0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00643Q86TS7 51 aa13.78□□□□□ -0.2
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CAPNS1-212ENST00000591041 PKD1P98161 4303 aa13.72□□□□□ -0.21
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CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa13.72□□□□□ -0.21
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CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf153Q5TBE3 101 aa13.71□□□□□ -0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00846Q9NV44 126 aa13.71□□□□□ -0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAH5Q8TE73 4624 aa13.71□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAH8Q96JB1 4490 aa13.69□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa13.69□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 IGFL1Q6UW32 110 aa13.67□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa13.66□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 XGP55808 180 aa13.66□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 SPINK6Q6UWN8 80 aa13.66□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 NREPQ16612 68 aa13.65□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM229BQ4G0N7 80 aa13.65□□□□□ -0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYGAP11844 174 aa13.64□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6Q795 121 aa13.64□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 IMUPQ9GZP8 106 aa13.63□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PNM2 257 aa13.61□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM229AH3BQW9 127 aa13.6□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa13.6□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK2AP2O75956 126 aa13.59□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZVQ6 151 aa13.59□□□□□ -0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa13.58□□□□□ -0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MT-ATP8P03928 68 aa13.58□□□□□ -0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MOBPQ13875 183 aa13.58□□□□□ -0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPG2P98160 4391 aa13.57□□□□□ -0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 SCGB1A1P11684 91 aa13.55□□□□□ -0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL6P80162 114 aa13.55□□□□□ -0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 SS18L2Q9UHA2 77 aa13.55□□□□□ -0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 BPY2O14599 106 aa13.5□□□□□ -0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 CD164Q04900 197 aa13.5□□□□□ -0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WSZ3 146 aa13.49□□□□□ -0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 ANAPC11Q9NYG5 84 aa13.48□□□□□ -0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa13.47□□□□□ -0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.42□□□□□ -0.26
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CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N1X5 172 aa13.41□□□□□ -0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0G2JQZ4 141 aa13.4□□□□□ -0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 HERC1Q15751 4861 aa13.39□□□□□ -0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa13.38□□□□□ -0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 TYMSOSQ8TAI1 123 aa13.38□□□□□ -0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 HRCT1Q6UXD1 115 aa13.36□□□□□ -0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087X002 238 aa13.34□□□□□ -0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 LIMD2Q9BT23 127 aa13.34□□□□□ -0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 Q5VSD8 79 aa13.32□□□□□ -0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 SPAG11AQ6PDA7 123 aa13.32□□□□□ -0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa13.31□□□□□ -0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFB1O75438 58 aa13.3□□□□□ -0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa13.27□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa13.27□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 SPINK1P00995 79 aa13.27□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa13.26□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 Q5XG85 94 aa13.26□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00472Q9H8W2 130 aa13.26□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ATOX1O00244 68 aa13.24□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS29P62273 56 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00304Q8N9R0 145 aa13.22□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 A8MWP4 228 aa13.21□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV4-1P06312 121 aa13.21□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR26Q8N8Z3 221 aa13.21□□□□□ -0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WVE0 104 aa13.19□□□□□ -0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 DSCR10P59022 87 aa13.19□□□□□ -0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM20Q8N5G0 67 aa13.19□□□□□ -0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa13.19□□□□□ -0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 ANAPC13Q9BS18 74 aa13.17□□□□□ -0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB116Q30KQ4 102 aa13.16□□□□□ -0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EQZ3 153 aa13.14□□□□□ -0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 PCP4P48539 62 aa13.14□□□□□ -0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR15Q8IV56 129 aa13.14□□□□□ -0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N9L7 120 aa13.13□□□□□ -0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 HCG22E2RYF7 251 aa13.1□□□□□ -0.31
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