RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.63□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 C20orf202A1L168 122 aa3.62□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.62□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 A0A1B0GWB2 263 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF815PA8K554 130 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 CFC1BP0CG36 223 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 COX7BP24311 80 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 KRTAP5-9P26371 169 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 TAL2Q16559 108 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 Q5XG85 94 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 PRO1933Q9H354 126 aa3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BKO60814 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BJP06899 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BOP23527 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BBP33778 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 PCP4P48539 62 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BDP58876 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BCP62807 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 VAMP3Q15836 100 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 LITAFQ99732 161 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.6□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.59□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 H7C2G1 150 aa3.59□□□□□ -1.83
LAMA3-211ENST00000590104 TCL1BO95988 128 aa3.58□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 NPC2P61916 151 aa3.58□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 C6orf99Q4VX62 202 aa3.58□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.58□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.58□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 A6NDN8 102 aa3.57□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 C3orf79P0CE67 100 aa3.57□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 MT1HP80294 61 aa3.57□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.56□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 KRTDAPP60985 99 aa3.56□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.56□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 F8WEM9 126 aa3.55□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 SNCGO76070 127 aa3.55□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.55□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.55□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 A0A0A0MQY5 61 aa3.54□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.54□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 Q6JHZ5 121 aa3.54□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.54□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.54□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.54□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 SCGB1D1O95968 90 aa3.53□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 Q1RN00 199 aa3.53□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.53□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 SMIM29Q86T20 159 aa3.53□□□□□ -1.84
LAMA3-211ENST00000590104 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.52□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 KRTAP10-12P60413 245 aa3.52□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 C1orf195Q5TG92 126 aa3.52□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 hADV29S1A0JD25 119 aa3.51□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.51□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 PCOTHQ58A44 107 aa3.51□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.51□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 LINC00575Q6W349 94 aa3.51□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.51□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.51□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 M0R2T5 61 aa3.5□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 S100A2P29034 98 aa3.5□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.49□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 C9orf92A6NGG3 77 aa3.49□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 PCP2Q8IVA1 136 aa3.49□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 CLEC2BQ92478 149 aa3.49□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 C12orf57Q99622 126 aa3.49□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.49□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 ATOH7Q8N100 152 aa3.48□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.47□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 H0YGX0 51 aa3.47□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 S100A6P06703 90 aa3.47□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.47□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 Q6ZQY7 126 aa3.47□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.47□□□□□ -1.85
LAMA3-211ENST00000590104 H3BQ85 93 aa3.46□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 DLEU1O43261 78 aa3.46□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 S100A1P23297 94 aa3.46□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 LCE1FQ5T754 118 aa3.46□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 Q6Q795 121 aa3.46□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.46□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H4GQ99525 98 aa3.46□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.46□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 A0A1B0GX51 115 aa3.45□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 LST1O00453 97 aa3.45□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 KMT2DO14686 5537 aa3.45□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.45□□□□□ -1.86
LAMA3-211ENST00000590104 Q75L30 129 aa3.45□□□□□ -1.86
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