RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 UBE2BP63146 152 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 ACANP16112 2415 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 ITPR2Q14571 2701 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 A0A1W2PNM2 257 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 MP68P56378 58 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 C14orf177Q52M58 125 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 REG3GQ6UW15 175 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 V9GYY9 64 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 NOTCH2Q04721 2471 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 VWFP04275 2813 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 HCG22E2RYF7 251 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 SMIM29Q86T20 159 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 Q8N9L7 120 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 Q9BRP9 147 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 RETNQ9HD89 108 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 hDV103S1A0JD37 113 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP10-12P60413 245 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 HIVEP1P15822 2718 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 C16orf90A8MZG2 172 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 H0Y9J4 135 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 PSCAO43653 123 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 DSCR10P59022 87 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-212ENST00000580838 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 UBE2AP49459 152 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 Q1T7F1 81 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 K7EQZ3 153 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRM-212ENST00000580838 BRK1Q8WUW1 75 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 ATRQ13535 2644 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 FAM168BA1KXE4 195 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRM-212ENST00000580838 LCE1FQ5T754 118 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRM-212ENST00000580838 A8MWP4 228 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRM-212ENST00000580838 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 A0A087WSZ3 146 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 H0Y9P7 68 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRM-212ENST00000580838 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 LIMD2Q9BT23 127 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 CASC10Q5T4H9 136 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00208Q96KT6 92 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRM-212ENST00000580838 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRM-212ENST00000580838 MOBPQ13875 183 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 A0A1W2PNN7 141 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-212ENST00000580838 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-212ENST00000580838 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 K7EIL1 84 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRM-212ENST00000580838 TENM3Q9P273 2699 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 NUPR2A6NF83 97 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00483Q53H64 154 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 APLNQ9ULZ1 77 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-212ENST00000580838 MAST4O15021 2626 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 PSPHP1O15172 72 aa3.52□□□□□ -1.85
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