RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568693.1

E2F4-211, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 2

Gene E2F4, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-211	ENST00000568693	DNAL4	O96015	105 aa		5.08	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	FAT1	Q14517	4588 aa		5.07	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF861P	O60384	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693		Q6ZQY7	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.06	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.05	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.05	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693		H3BQ85	93 aa		5.04	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.03	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
E2F4-211	ENST00000568693	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		5.02	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		5.02	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.02	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.01	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	SPRR1B	P22528	89 aa		5	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	LINC00483	Q53H64	154 aa		5	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693		Q5VSD8	79 aa		5	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693		Q8N377	158 aa		5	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		5	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.99	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
E2F4-211	ENST00000568693	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693		F8WEM9	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	ACYP1	P07311	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693		A0A1B0GV72	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.92	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693		A0A087X002	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	PDE6G	P18545	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693		Q8NBF4	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
E2F4-211	ENST00000568693	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.9	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	CRYGA	P11844	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	MOBP	Q13875	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693		Q6JHZ5	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	HERC1	Q15751	4861 aa		4.9	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693		Q6ZQT0	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	CCK	P06307	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	PCP4	P48539	62 aa		4.86	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693		Q6Q795	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.86	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	TNXB	P22105	4242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693		A0A1B0GW54	56 aa		4.85	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693		A0A1W2PNM2	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	CD164	Q04900	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.82	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	OXT	P01178	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.81	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693		A0A087WSZ3	146 aa		4.8	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.8	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	SPINK1	P00995	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms