RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2A	P49459	152 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf26	Q17RF5	130 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559	HCG22	E2RYF7	251 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SPRR1B	P22528	89 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LYST	Q99698	3801 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WSZ3	146 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CHTF8	P0CG12	524 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JQZ4	141 aa		11.47	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.47	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RRN3-205	ENST00000563559	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RRN3-205	ENST00000563559	NUPR2	A6NF83	97 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MDFI	Q99750	246 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PRR15	Q8IV56	129 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFB1	O75438	58 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MP68	P56378	58 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRN3-205	ENST00000563559		A8MWP4	228 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RRN3-205	ENST00000563559	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PANO1	I0J062	215 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CASC2	Q6XLA1	102 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRN3-205	ENST00000563559	hDV103S1	A0JD37	113 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559		H3BPC8	53 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WTM6	91 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00483	Q53H64	154 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00208	Q96KT6	92 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RRN3-205	ENST00000563559		H0Y9P7	68 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PRO0628	Q9UI54	55 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RTL8C	O15255	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRN3-205	ENST00000563559	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559		Q96NJ1	140 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MOBP	Q13875	183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559		Q1T7F1	81 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PRR4	Q16378	134 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZR54	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF861P	O60384	105 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CDK2AP2	O75956	126 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RRN3-205	ENST00000563559	BRK1	Q8WUW1	75 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GVX0	72 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RRN3-205	ENST00000563559		V9GYY9	64 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RRN3-205	ENST00000563559	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.96	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	KMT2A	Q03164	3969 aa		10.96	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV7-43	P04211	117 aa		10.96	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	TG	P01266	2768 aa		10.96	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFS5	O43920	106 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.92	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	CD164	Q04900	197 aa		10.91	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf195	Q5TG92	126 aa		10.91	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.9	□□□□□ -0.66
RRN3-205	ENST00000563559	PSPHP1	O15172	72 aa		10.9	□□□□□ -0.67
RRN3-205	ENST00000563559	LIMD2	Q9BT23	127 aa		10.88	□□□□□ -0.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.7 ms