RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 COX19Q49B96 90 aa4.31□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00158P58513 81 aa4.3□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 FA2HQ7L5A8 372 aa4.3□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPRR1BP22528 89 aa4.29□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 BAGE3Q86Y29 109 aa4.29□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.29□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.29□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.28□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 S100A6P06703 90 aa4.28□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM13P0DJ93 91 aa4.28□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q5XG85 94 aa4.28□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.28□□□□□ -1.72
USP3-AS1-204ENST00000559861 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.27□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.27□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 MT2AP02795 61 aa4.27□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.27□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.27□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM223A0PJW6 202 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDTP30046 118 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 NMUP48645 174 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD164Q04900 197 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 PMCHL1Q16048 86 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 MT1FP04733 61 aa4.25□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00614P0C842 121 aa4.25□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 S100A12P80511 92 aa4.25□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1orf195Q5TG92 126 aa4.25□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.24□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 FABP4P15090 132 aa4.24□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.24□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.24□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 NEBP20929 6669 aa4.24□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.23□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 HBDP02042 147 aa4.23□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 S100A2P29034 98 aa4.23□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKR1D1P51857 326 aa4.23□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.23□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSBP1O75506 76 aa4.22□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.22□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.22□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFC2O95298 119 aa4.21□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00587B1AMM8 73 aa4.2□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 H7C2G1 150 aa4.2□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.2□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.2□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.19□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 H0Y8G0 127 aa4.19□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 C3orf79P0CE67 100 aa4.19□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTDAPP60985 99 aa4.19□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6Q795 121 aa4.19□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.19□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.18□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 LEPROTL1O95214 131 aa4.18□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.18□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 PP632Q6XCG6 107 aa4.18□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRO1933Q9H354 126 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.16□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 PYY3Q5JQD4 70 aa4.16□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCP2Q8IVA1 136 aa4.16□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATOH7Q8N100 152 aa4.16□□□□□ -1.74
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.15□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.14□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A0G2JQZ4 141 aa4.14□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 C20orf202A1L168 122 aa4.14□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 C12orf57Q99622 126 aa4.14□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC01545Q5VT33 79 aa4.13□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.12□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 LEPROTO15243 131 aa4.12□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM6P0DI80 62 aa4.12□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP10-10P60014 251 aa4.12□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.12□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.12□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 J3QQQ9 107 aa4.11□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE1CQ5T751 118 aa4.11□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.11□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.11□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 DPM2O94777 84 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPC2P61916 151 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00846Q9NV44 126 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPANXCQ9NY87 97 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCL1BO95988 128 aa4.09□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKCP01834 107 aa4.09□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 C6orf99Q4VX62 202 aa4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms