RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556782.5

PRPF39-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF39, Length 645 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-211ENST00000556782 C3orf79P0CE67 100 aa3.03□□□□□ -1.92
PRPF39-211ENST00000556782 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PRPF39-211ENST00000556782 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.03□□□□□ -1.92
PRPF39-211ENST00000556782 SPANXCQ9NY87 97 aa3.03□□□□□ -1.92
PRPF39-211ENST00000556782 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.03□□□□□ -1.92
PRPF39-211ENST00000556782 C5orf52A6NGY3 159 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 Q8N377 158 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 KRTDAPP60985 99 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 C20orf202A1L168 122 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 SPRR1BP22528 89 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 LINC00518Q8N0U6 118 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 SLC25A20O43772 301 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 COX7BP24311 80 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 C6orf99Q4VX62 202 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 ATOH7Q8N100 152 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.98□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 IFITM1P13164 125 aa2.98□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.98□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.98□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 Q6ZVH6 145 aa2.98□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 COPS9Q8WXC6 57 aa2.98□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 AKR1D1P51857 326 aa2.97□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 PCP2Q8IVA1 136 aa2.97□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 LIMD2Q9BT23 127 aa2.97□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.97□□□□□ -1.93
PRPF39-211ENST00000556782 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 A0A1B0GWB2 263 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 A6NDN8 102 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 TAL2Q16559 108 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 Q1RN00 199 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 CD164Q04900 197 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 PRO1933Q9H354 126 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 A4D1N5 150 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 H7C2G1 150 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 S100A2P29034 98 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.93□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 Q5XG85 94 aa2.93□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 A0A0G2JQZ4 141 aa2.92□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 C9orf92A6NGG3 77 aa2.92□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 S100A1P23297 94 aa2.92□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.92□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 S100A6P06703 90 aa2.91□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 VAMP3Q15836 100 aa2.91□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 C1orf195Q5TG92 126 aa2.91□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 LINC00575Q6W349 94 aa2.91□□□□□ -1.94
PRPF39-211ENST00000556782 hADV29S1A0JD25 119 aa2.9□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 F8WEM9 126 aa2.9□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 PCOTHQ58A44 107 aa2.9□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 Q6ZQY7 126 aa2.9□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 C12orf57Q99622 126 aa2.9□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.89□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 TCL1BO95988 128 aa2.89□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 COX8AP10176 69 aa2.89□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 HIST1H4GQ99525 98 aa2.89□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.88□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 DLEU1O43261 78 aa2.88□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.88□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.88□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 Q6JHZ5 121 aa2.88□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 CLEC2BQ92478 149 aa2.88□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 PRAC1Q96KF2 57 aa2.88□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.87□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 IGFL1Q6UW32 110 aa2.87□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.87□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 MT1HP80294 61 aa2.86□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.86□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.86□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 C14orf144Q96I85 54 aa2.86□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 HIGD1BQ9P298 99 aa2.86□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 A0A0B4J2C4 111 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 SPATA45Q537H7 98 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 RAB37Q96AX2 223 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 VAMP8Q9BV40 100 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-211ENST00000556782 H0YGX0 51 aa2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms