RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC01545Q5VT33 79 aa4.95□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COPS9Q8WXC6 57 aa4.95□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PET117Q6UWS5 81 aa4.94□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.94□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A6NDN8 102 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COLCA2A8K830 154 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IFITM1P13164 125 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.92□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6ZVH6 145 aa4.92□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 F8WEM9 126 aa4.91□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.91□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.9□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6Q795 121 aa4.9□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PCP2Q8IVA1 136 aa4.9□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C3orf79P0CE67 100 aa4.89□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q75L30 129 aa4.89□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.89□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.89□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BKO60814 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BJP06899 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BOP23527 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BBP33778 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BDP58876 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BCP62807 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VAMP3Q15836 100 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6JHZ5 121 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.87□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.87□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CFC1P0CG37 223 aa4.86□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTDAPP60985 99 aa4.86□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00575Q6W349 94 aa4.86□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.86□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CLEC2BQ92478 149 aa4.86□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 hADV29S1A0JD25 119 aa4.85□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C20orf202A1L168 122 aa4.85□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGFL1Q6UW32 110 aa4.85□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6ZQY7 126 aa4.85□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.84□□□□□ -1.63
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q96NJ1 140 aa4.83□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LST1O00453 97 aa4.82□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.81□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATOH7Q8N100 152 aa4.81□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.81□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SCGB1D1O95968 90 aa4.8□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.8□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.8□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.8□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.79□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 USH2AO75445 5202 aa4.78□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A8MUU9 505 aa4.78□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.78□□□□□ -1.64
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SSPOA2VEC9 5147 aa4.77□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C9orf118A6NHY6 69 aa4.77□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H3BUT2 72 aa4.76□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TEN1Q86WV5 123 aa4.75□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C12orf57Q99622 126 aa4.74□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.73□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNCGO76070 127 aa4.73□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.72□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MT2AP02795 61 aa4.72□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM236CP0DP71 79 aa4.72□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A087WSZ3 146 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H4GQ99525 98 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DSCR10P59022 87 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H0YGX0 51 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00313P59037 77 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H3BMG7 143 aa4.68□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MT1FP04733 61 aa4.68□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP10-10P60014 251 aa4.68□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.68□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 S100A2P29034 98 aa4.67□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SIGMAR1Q99720 223 aa4.67□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HRES1P13985 223 aa4.66□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.66□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.66□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAB37Q96AX2 223 aa4.66□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.66□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1B0GX51 115 aa4.65□□□□□ -1.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGKV4-1P06312 121 aa4.65□□□□□ -1.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.65□□□□□ -1.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1W2PNM2 257 aa4.64□□□□□ -1.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COX8AP10176 69 aa4.64□□□□□ -1.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FABP2P12104 132 aa4.64□□□□□ -1.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.64□□□□□ -1.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00846Q9NV44 126 aa4.64□□□□□ -1.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms