RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528246.5

MSRA-210, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRA, Length 1,706 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-210ENST00000528246 C16orf90A8MZG2 172 aa6.52□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 HCG22E2RYF7 251 aa6.52□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 SPRR1BP22528 89 aa6.51□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.51□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.51□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.51□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.51□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.51□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 H3BPC8 53 aa6.5□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.5□□□□□ -1.37
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MSRA-210ENST00000528246 hDV103S1A0JD37 113 aa6.49□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 C14orf177Q52M58 125 aa6.49□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 CASC10Q5T4H9 136 aa6.49□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 IGFL1Q6UW32 110 aa6.49□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.49□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 PSCAO43653 123 aa6.48□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.47□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.47□□□□□ -1.37
MSRA-210ENST00000528246 Q1T7F1 81 aa6.47□□□□□ -1.37
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MSRA-210ENST00000528246 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 TENM2Q9NT68 2774 aa6.45□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 MP68P56378 58 aa6.45□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.45□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.45□□□□□ -1.38
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MSRA-210ENST00000528246 RYR2Q92736 4967 aa6.44□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.43□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.43□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 V9GYY9 64 aa6.43□□□□□ -1.38
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MSRA-210ENST00000528246 A0A087WSZ3 146 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 UBE2AP49459 152 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 PRR15Q8IV56 129 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 A8MWP4 228 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 A0A1W2PNN7 141 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-210ENST00000528246 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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MSRA-210ENST00000528246 PRLHP81277 87 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-210ENST00000528246 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-210ENST00000528246 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.38□□□□□ -1.39
MSRA-210ENST00000528246 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.38□□□□□ -1.39
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MSRA-210ENST00000528246 CASC2Q6XLA1 102 aa6.37□□□□□ -1.39
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MSRA-210ENST00000528246 C1orf195Q5TG92 126 aa6.36□□□□□ -1.39
MSRA-210ENST00000528246 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.36□□□□□ -1.39
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MSRA-210ENST00000528246 APLNQ9ULZ1 77 aa6.34□□□□□ -1.39
MSRA-210ENST00000528246 H0Y9P7 68 aa6.33□□□□□ -1.4
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MSRA-210ENST00000528246 MOBPQ13875 183 aa6.32□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.31□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 LINC00483Q53H64 154 aa6.31□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.31□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.31□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.31□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.3□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 LIMD2Q9BT23 127 aa6.3□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 A0A0G2JQZ4 141 aa6.3□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.3□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.3□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.29□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.28□□□□□ -1.4
MSRA-210ENST00000528246 Q6ZR54 194 aa6.27□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.26□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 CHTF8P0CG12 524 aa6.26□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.26□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 Q96NJ1 140 aa6.26□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.25□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 NUPR2A6NF83 97 aa6.25□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 RYR1P21817 5038 aa6.23□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.22□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 HERC2O95714 4834 aa6.22□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 PRR4Q16378 134 aa6.22□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.22□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.22□□□□□ -1.41
MSRA-210ENST00000528246 A0A1B0GVX0 72 aa6.21□□□□□ -1.42
MSRA-210ENST00000528246 Q5VV11 94 aa6.21□□□□□ -1.42
MSRA-210ENST00000528246 PSPHP1O15172 72 aa6.2□□□□□ -1.42
MSRA-210ENST00000528246 Q75L30 129 aa6.19□□□□□ -1.42
MSRA-210ENST00000528246 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
MSRA-210ENST00000528246 A8MUN3 132 aa6.19□□□□□ -1.42
MSRA-210ENST00000528246 COA5Q86WW8 74 aa6.18□□□□□ -1.42
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