RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 LIMD2Q9BT23 127 aa3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 A0A0J9YXY3 114 aa3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 J3QQQ9 107 aa3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 HERVK_113P61574 105 aa3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 TAL2Q16559 108 aa3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 YPEL4Q96NS1 127 aa3.68□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 LEPROTL1O95214 131 aa3.67□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 APOC3P02656 99 aa3.67□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 SPRR1BP22528 89 aa3.67□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.67□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.67□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 DPM2O94777 84 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 SPANXCQ9NY87 97 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
PDE4D-222ENST00000514552 IGKCP01834 107 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 CD164Q04900 197 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 MT1HP80294 61 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 Q5XG85 94 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 Q8N9L7 120 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 TIMM17BO60830 172 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 PCOTHQ58A44 107 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 TRGC2P03986 189 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 LCE3AQ5TA76 89 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 PRO1933Q9H354 126 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 H7C2G1 150 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 FABP4P15090 132 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 COX7BP24311 80 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 NPC2P61916 151 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 COPS9Q8WXC6 57 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-222ENST00000514552 A6NDN8 102 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 C9orf92A6NGG3 77 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 AKR1D1P51857 326 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 C6orf99Q4VX62 202 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf195Q5TG92 126 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 LINC01545Q5VT33 79 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H4GQ99525 98 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF815PA8K554 130 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 TCL1BO95988 128 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 IFITM1P13164 125 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 COLCA2A8K830 154 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 M0R2T5 61 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-222ENST00000514552 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BKO60814 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BJP06899 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BOP23527 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BBP33778 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BDP58876 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BCP62807 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 Q6JHZ5 121 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 C20orf202A1L168 122 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 F8WEM9 126 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 C3orf79P0CE67 100 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 CLEC2BQ92478 149 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 USH2AO75445 5202 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 A0A0G2JQZ4 141 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 LINC00575Q6W349 94 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 Q6ZQY7 126 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-222ENST00000514552 hADV29S1A0JD25 119 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-222ENST00000514552 KRTDAPP60985 99 aa3.46□□□□□ -1.86
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