RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 H0Y9J4 135 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZR54 194 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 TGP01266 2768 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM258P61165 79 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 LYSTQ99698 3801 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 K7EQZ3 153 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 DSCR10P59022 87 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 SPRR1BP22528 89 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-208ENST00000510829 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 J3KT08 172 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 HCG22E2RYF7 251 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM236CP0DP71 79 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 KLKP1Q107X0 134 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 OCR1Q9BZK8 76 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF861PO60384 105 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 MOBPQ13875 183 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 FBN3Q75N90 2809 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 H7BZZ5 65 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFB1O75438 58 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-208ENST00000510829 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFC1O43677 76 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-2P60368 255 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 CASC2Q6XLA1 102 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 CDK2AP2O75956 126 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV7-43P04211 117 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 A8MWP4 228 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 DNHD1Q96M86 4753 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 PRR15Q8IV56 129 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0U1RQV1 116 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 MP68P56378 58 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00483Q53H64 154 aa6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 C5orf47Q569G3 176 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFS5O43920 106 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00208Q96KT6 92 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-1P60331 282 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 hDV103S1A0JD37 113 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 PRR4Q16378 134 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 H0Y9P7 68 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 OXTP01178 125 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-208ENST00000510829 KMT2AQ03164 3969 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 Q96NJ1 140 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GVX0 72 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 LCE6AA0A183 80 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZSA8 131 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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RABGEF1-208ENST00000510829 C4orf26Q17RF5 130 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BPC8 53 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 CD164Q04900 197 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH2Q9P225 4427 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 PCOTHQ58A44 107 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.44□□□□□ -1.38
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