RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506827.1

ITGA3-209, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-209ENST00000506827 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-209ENST00000506827 A0A087X002 238 aa8.76□□□□□ -1.01
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ITGA3-209ENST00000506827 KRTAP10-8P60410 259 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-209ENST00000506827 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-209ENST00000506827 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-209ENST00000506827 SMIM29Q86T20 159 aa8.74□□□□□ -1.01
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ITGA3-209ENST00000506827 UBE2V1Q13404 147 aa8.71□□□□□ -1.02
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ITGA3-209ENST00000506827 MYCBP2O75592 4640 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGA3-209ENST00000506827 CD164Q04900 197 aa8.63□□□□□ -1.03
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ITGA3-209ENST00000506827 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA3-209ENST00000506827 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ITGA3-209ENST00000506827 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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ITGA3-209ENST00000506827 DSCR8Q96T75 97 aa8.59□□□□□ -1.03
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ITGA3-209ENST00000506827 F8W1H4 67 aa8.58□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 PDE6GP18545 87 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 Q6Q795 121 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 TEN1Q86WV5 123 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 MTURNQ8N3F0 131 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 LIMD2Q9BT23 127 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 PRO0461Q9UI25 63 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 TNXBP22105 4242 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-209ENST00000506827 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.53□□□□□ -1.04
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ITGA3-209ENST00000506827 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.52□□□□□ -1.05
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ITGA3-209ENST00000506827 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-209ENST00000506827 A0A1B0GV90 55 aa8.51□□□□□ -1.05
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ITGA3-209ENST00000506827 Q5XG85 94 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-209ENST00000506827 A0A1B0GW54 56 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-209ENST00000506827 CCKP06307 115 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-209ENST00000506827 A0A1W2PNM2 257 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-209ENST00000506827 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-209ENST00000506827 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-209ENST00000506827 Q6ZQT0 140 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-209ENST00000506827 VPS25Q9BRG1 176 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-209ENST00000506827 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-209ENST00000506827 A0A087WSZ3 146 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA3-209ENST00000506827 ETDBQ3ZM63 59 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA3-209ENST00000506827 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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ITGA3-209ENST00000506827 C1orf195Q5TG92 126 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA3-209ENST00000506827 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA3-209ENST00000506827 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.33□□□□□ -1.08
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ITGA3-209ENST00000506827 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA3-209ENST00000506827 J3KT08 172 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-209ENST00000506827 ACYP1P07311 99 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGA3-209ENST00000506827 Q96NJ1 140 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGA3-209ENST00000506827 HERC1Q15751 4861 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 J3QR89 54 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 IGKV4-1P06312 121 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 TPRXLQ17RH7 258 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 UBL5Q9BZL1 73 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 SIGMAR1Q99720 223 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 LINC00846Q9NV44 126 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 NDUFB1O75438 58 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 Q6ZVQ6 151 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-209ENST00000506827 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA3-209ENST00000506827 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGA3-209ENST00000506827 BPY2O14599 106 aa8.19□□□□□ -1.1
ITGA3-209ENST00000506827 CDIP1Q9H305 208 aa8.19□□□□□ -1.1
ITGA3-209ENST00000506827 A8MWP4 228 aa8.17□□□□□ -1.1
ITGA3-209ENST00000506827 A0A1B0GVX0 72 aa8.15□□□□□ -1.1
ITGA3-209ENST00000506827 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.14□□□□□ -1.11
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