RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 Q8N377 158 aa10.42□□□□□ -0.74
CTDSP1-215ENST00000498160 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.41□□□□□ -0.74
CTDSP1-215ENST00000498160 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.41□□□□□ -0.74
CTDSP1-215ENST00000498160 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A087X002 238 aa10.4□□□□□ -0.74
CTDSP1-215ENST00000498160 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.4□□□□□ -0.74
CTDSP1-215ENST00000498160 Q8NBF4 154 aa10.4□□□□□ -0.74
CTDSP1-215ENST00000498160 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.4□□□□□ -0.74
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CTDSP1-215ENST00000498160 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.38□□□□□ -0.75
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CTDSP1-215ENST00000498160 SMIM29Q86T20 159 aa10.36□□□□□ -0.75
CTDSP1-215ENST00000498160 UBE2V1Q13404 147 aa10.35□□□□□ -0.75
CTDSP1-215ENST00000498160 MOBPQ13875 183 aa10.35□□□□□ -0.75
CTDSP1-215ENST00000498160 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
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CTDSP1-215ENST00000498160 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP1-215ENST00000498160 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP1-215ENST00000498160 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.32□□□□□ -0.76
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1HL1P0DM35 61 aa10.32□□□□□ -0.76
CTDSP1-215ENST00000498160 H3BT86 120 aa10.31□□□□□ -0.76
CTDSP1-215ENST00000498160 K7EP34 96 aa10.31□□□□□ -0.76
CTDSP1-215ENST00000498160 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.31□□□□□ -0.76
CTDSP1-215ENST00000498160 C9JAW5 83 aa10.3□□□□□ -0.76
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CTDSP1-215ENST00000498160 MYCBP2O75592 4640 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDSP1-215ENST00000498160 H3BMG7 143 aa10.29□□□□□ -0.76
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CTDSP1-215ENST00000498160 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.28□□□□□ -0.76
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CTDSP1-215ENST00000498160 CD164Q04900 197 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDSP1-215ENST00000498160 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.26□□□□□ -0.77
CTDSP1-215ENST00000498160 SPINK1P00995 79 aa10.25□□□□□ -0.77
CTDSP1-215ENST00000498160 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CTDSP1-215ENST00000498160 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.25□□□□□ -0.77
CTDSP1-215ENST00000498160 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CTDSP1-215ENST00000498160 TNXBP22105 4242 aa10.21□□□□□ -0.78
CTDSP1-215ENST00000498160 IGFL1Q6UW32 110 aa10.2□□□□□ -0.78
CTDSP1-215ENST00000498160 DSCR8Q96T75 97 aa10.2□□□□□ -0.78
CTDSP1-215ENST00000498160 LIMD2Q9BT23 127 aa10.2□□□□□ -0.78
CTDSP1-215ENST00000498160 PDE6GP18545 87 aa10.19□□□□□ -0.78
CTDSP1-215ENST00000498160 F8W1H4 67 aa10.18□□□□□ -0.78
CTDSP1-215ENST00000498160 Q6Q795 121 aa10.18□□□□□ -0.78
CTDSP1-215ENST00000498160 TEN1Q86WV5 123 aa10.17□□□□□ -0.78
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CTDSP1-215ENST00000498160 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.15□□□□□ -0.78
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CTDSP1-215ENST00000498160 Q5XG85 94 aa10.13□□□□□ -0.79
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CTDSP1-215ENST00000498160 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.12□□□□□ -0.79
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CTDSP1-215ENST00000498160 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.12□□□□□ -0.79
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1B0GW54 56 aa10.11□□□□□ -0.79
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CTDSP1-215ENST00000498160 CCKP06307 115 aa10.1□□□□□ -0.79
CTDSP1-215ENST00000498160 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.1□□□□□ -0.79
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1B0GV90 55 aa10.09□□□□□ -0.79
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CTDSP1-215ENST00000498160 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.06□□□□□ -0.8
CTDSP1-215ENST00000498160 Q6ZQT0 140 aa10.06□□□□□ -0.8
CTDSP1-215ENST00000498160 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.06□□□□□ -0.8
CTDSP1-215ENST00000498160 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CTDSP1-215ENST00000498160 VPS25Q9BRG1 176 aa10.03□□□□□ -0.8
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A087WSZ3 146 aa10.01□□□□□ -0.81
CTDSP1-215ENST00000498160 ETDBQ3ZM63 59 aa9.99□□□□□ -0.81
CTDSP1-215ENST00000498160 PRR4Q16378 134 aa9.94□□□□□ -0.82
CTDSP1-215ENST00000498160 C1orf195Q5TG92 126 aa9.93□□□□□ -0.82
CTDSP1-215ENST00000498160 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.92□□□□□ -0.82
CTDSP1-215ENST00000498160 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.9□□□□□ -0.82
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CTDSP1-215ENST00000498160 HERC1Q15751 4861 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDSP1-215ENST00000498160 ACYP1P07311 99 aa9.85□□□□□ -0.83
CTDSP1-215ENST00000498160 TPRXLQ17RH7 258 aa9.85□□□□□ -0.83
CTDSP1-215ENST00000498160 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.85□□□□□ -0.83
CTDSP1-215ENST00000498160 Q96NJ1 140 aa9.84□□□□□ -0.83
CTDSP1-215ENST00000498160 UBL5Q9BZL1 73 aa9.83□□□□□ -0.84
CTDSP1-215ENST00000498160 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.82□□□□□ -0.84
CTDSP1-215ENST00000498160 J3QR89 54 aa9.82□□□□□ -0.84
CTDSP1-215ENST00000498160 IGKV4-1P06312 121 aa9.81□□□□□ -0.84
CTDSP1-215ENST00000498160 SIGMAR1Q99720 223 aa9.81□□□□□ -0.84
CTDSP1-215ENST00000498160 NDUFB1O75438 58 aa9.77□□□□□ -0.85
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.76□□□□□ -0.85
CTDSP1-215ENST00000498160 Q6ZVQ6 151 aa9.76□□□□□ -0.85
CTDSP1-215ENST00000498160 LINC00846Q9NV44 126 aa9.76□□□□□ -0.85
CTDSP1-215ENST00000498160 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDSP1-215ENST00000498160 BPY2O14599 106 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDSP1-215ENST00000498160 CDIP1Q9H305 208 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDSP1-215ENST00000498160 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.72□□□□□ -0.85
CTDSP1-215ENST00000498160 A8MWP4 228 aa9.71□□□□□ -0.86
CTDSP1-215ENST00000498160 C8orf87E5RJ46 101 aa9.71□□□□□ -0.86
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